МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ ГОУ ВПО РОССИЙСКО-АРМЯНСКИЙ (СЛАВЯНСКИЙ) УНИВЕРСИТЕТ Составлена в соответствии с федеральными государственными требованиями к структуре основной профессиональной образовательной программы послевузовского профессионального образования (аспирантура) УТВЕРЖДАЮ: Проректор по науке _____________ П.С. Аветисян «____» __________ 2014г. Институт математики и высоких технологий Кафедра - Медицинской биохимии и биотехнологии Учебная программа подготовки аспиранта ДИСЦИПЛИНА: ФД.А.01 Общая биохимия наименование дисциплины по учебному плану подготовки аспиранта Գ.00.16 Биоинформатика Шифр наименование научной специальности Программа одобрена на заседании Кафедры протокол Утверждена Ученым Советом РАУ Протокол Заведующий кафедрой № __9___ от __14.04.________2014г. № ___12___ от ___17.04________2014г. К.Б.Назарян , док. биол. наук, проф. Подпись И.О.Ф, ученая степень, звание Ереван 2014 2 ПРОГРАММА ПО БИОЛОГИЧЕСКОЙ ХИМИИ Программа по биологической химии для аспирантов высших учебных учреждений составлена на основании программы по биологической химии. ВВЕДЕНИЕ Преподавание биохимии на медико-профилактическом факультете медицинских высших учебных учреждений должно проводиться с учетом специфических особенностей будущей профессии. Программа по биологической химия для аспирантов этого факультета составлена с учетом опыта преподавания биохимии на лечебно-профилактическом и педиатрическом факультетах. Курс биохимии традиционно составляется из нескольких разделов: а) статической биохимии, изучающей химический состав организма и строение основных классов органических соединений, входящих в состав живых объектов; б) динамической биохимии, изучающий превращения основных химических структурных компонентов тканей, раздел регуляции процессов жизнедеятельности; в) функциональной биохимии, изучающий особенности метаболизма в отдельных органах и тканях и его взаимосвязь с их функциональной активностью. В основу содержания данной программы положена медицинская биохимия, которая изучает химические основы процессов жизнедеятельности человека в норме и знакомит с возможными причинами и последствиями нарушений метаболических реакций. В соответствии с конечными целями подготовки специалистов на медико-профилактическом факультете данная программа включает в себя профильные вопросы о влиянии факторов окружающей среды на метаболические процессы (питание, ксенобиотики, физические факторы окружающей среды и др.). Цель и задачи биологической химии: Основной целью курса является изучение: • основ молекулярной организации клетки, принципов метаболизма основных классов органических соединений и их связь с функциональной активностью организма с учетом онтогенеза; • молекулярных механизмов развития патологических процессов, в том числе и вызываемых влиянием факторов внешней среды; • биохимических методов исследования состояния здоровья человека. Задачами изучения курса биохимии являются: 1) формирование знаний об основных принципах молекулярной организации клетки, ткани, организма; 2) усвоение основных закономерностей метаболических процессов, регуляции метаболизма и его взаимосвязи с функциональной активностью живой системы; 3) формирование знаний о методах биохимических исследований, умение использовать их результаты для оценки состояния здоровья человека; 4) обучение пониманию патогенетических механизмов развития патологических процессов и формирование умения использовать приобретенные знания при обучении на гигиенических кафедрах; 5) приобретение знаний о принципах клинико-лабораторных и экспертных санитарногигиенических технологий и навыков работы с ними. Перечень дисциплин и тем, усвоение которых необходимы для усвоения биологической химии: а) биоорганическая химия. Практически все темы этой дисциплины важны для курса биохимии; 3 б) физика и биофизическая химия: методы исследования макромолекул, растворы высокомолекулярных соединений, основы спектрофотометрии, методы объемного анализа; в) биология: генетика; г) гистология: строение клеток, органов, тканей; д) физиология: функции отдельных органов и систем. В соответствии с учебным планом на преподавание биологической химии на медкопрофилактичесом факультете медицинского университета выделено следующее количество часов: Всего часов Аудиторные занятия Семестр Итого № п/п 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 108 36 36 Самостоятельная работа 1 72 72 Тематический план лекций Наименование раздела, темы Форма контроля зачет Количество часов Введение в биохимию. Структура и функции белков 3 Ферменты, свойства и механизм действия 3 Введение в метаболизм. Биологическое окисление. Центральные 3 метаболические пути Обмен и функции углеводов 3 Обмен и функции липидов 3 Обмен простых белков и аминокислот 3 Обмен нуклеотидов. Строение и синтез нуклеиновых кислот. 3 Биосинтез белков. Методы молекулярной биологии Биохимия гормонов 3 Перекисное окисление липидов, антиоксидантные системы, 2 жирорастворимые витамины Биохимия мембран 2 Биохимия питания. Витамины, свойства и механизм действия 2 Обмен воды и минеральных солей 2 Биохимия органов и тканей 2 Взаимосвязь и регуляция метаболизма 1 Основы клинической биохимии 1 ИТОГО: 36 4 № п/п 1 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. Тематический план лабораторных занятий по биологической химии Наименование раздела, темы Введение в биохимию. Структура и функции белков Ферменты. Свойства, методы количественного определения активности Белки. Ферменты (контрольное занятие) Витамины: свойства, методы определения. Биологическое окисление, энергетический обмен. Контрольное занятие по данному разделу Обмен углеводов. Методы определения ферментов и субстратов обмена углеводов. Контрольное занятие по данному разделу Обмен липидов. Методы определения ферментов и субстратов обмена липидов. Контрольное занятие по данному разделу Обмен аминокислот. Методы определения ферментов и субстратов обмена аминокислот. Обмен нуклеотидов, нуклеиновых кислот. Биосинтез белка. Контрольное занятие по данному разделу. Гормоны. Свойства, методы определения. Биохимия печени, обмен билирубина. Исследование крови и мочи. Экспрессметоды. Контрольное занятие по данному разделу. Исследование желудочного сока Контроль практических навыков. Зачетное занятие ВВЕДЕНИЕ Предмет и значение биологической химии. Объекты биохимического исследования. Важнейшие этапы развития биохимии. Место биохимии в медицинском образовании и в работе врачей-профилактиков. Основные разделы и направления в биохимии. Медицинская биохимия. Роль биохимии в понимании взаимоотношений человека и окружающей среды. ВВЕДЕНИЕ Клетка как самовоспроизводящийся химический реактор. Потоки вещества, энергии и информации в клетке. Единство химического состава и типов превращений веществ в живых системах. Химический состав клеток. Способы существования организмов: аутотрофия, гетеротрофия. Определение понятий об обмене веществ, энергии и информации: метаболизм, катаболизм, анаболизм, рецепторные системы, хранение и передача генетической информации. Координация метаболизма в клетках, колониях микроорганизмов, тканях и органах. Специализация метаболизма. Биохимическая эволюция. БЕЛКИ: СТРУКТУРА И ФУНКЦИЯ Краткий исторический очерк по развитию химии белков: открытие аминокислот, становление пептидной теории строения. Классификация белков по функциям, форме белковой молекулы, степени сложности состава. Физико-химические свойства белков и белковых растворов. Способы получения белковых препаратов. Современные представления о структуре белковой молекулы. Первичная структура, типы связей, свойства пептидной связи. Методы исследования первичной структуры. Конформация полипептидной цепи. Вторичная структурная организация, типы вторичной структуры, Роль водородных связей в ее стабилизации. Надвторичная структура и ее типы. Третичная структура. Роль слабого внутримолекулярного взаимодействия в стабилизации пространственной структуры и изменениях конформации. Зависимость биологической активности белков от конформационых изменений. Денатурация белков, обратимость денатурации. Четвертичная структурная организация белков. Функциональные особенности белков с четвертичной структурой. Способность к специфическим взаимодействиям - основа биологических функций всех белков. Понятие «комплементарность». Лиганды и функция белков. 5 Обратимость связывания. Количественное определение индивидуальных белков на основе их биологических свойств. Методы фракционирования белков. Различия аминокислотного состава белков различных органов и тканей и значение этого факта в биохимии питания. Изменения белкового состава тканей в онтогенезе и при заболеваниях. Сложные белки. Общие представления о строении сложных белков, строение простетических групп, типы связей между апобелком и простетической группой. Особенности строения мембрано-связанных белков. Структурные белки (коллаген, кератины). Посттрансляционная модификация белков. Связь между первичной и высшими степенями структурной организации белков. "Консервированные" и гомологичные последовательности аминокислот в белках. Взаимодействие белков и низкомолекулярных лигандов (миоглобин, гемоглобин). Сравнительная биохимия и эволюция белков. ФЕРМЕНТЫ История открытия и изучения ферментов. Классификация и номенклатура ферментов. Свойства ферментов. Зависимость скорости ферментативных реакций от температуры, рH, концентраций фермента и субстрата. Единицы измерения активности и количества ферментов. Механизмы регуляции активности ферментов: конкурентное ингибирование, аллостерические ферменты, регуляция путем ковалентной модификации структуры. Роль кооперативных изменений конформации ферментов в механизмах катализа реакций. Естественные и искусственные ингибиторы активности. Использование в медицине и санитарноэпидемиологической службе. Структурная организация ферментов в клетке. Различия ферментного состава, клеток, органов и тканей. Органоспецифические ферменты. Определение активности ферментов в крови с диагностической целью; происхождение ферментов плазмы крови. Изоферменты. Ферменты как лекарственные препараты. Ферменты как аналитические реагенты в лабораторных исследованиях, иммобилизованные ферменты. ВИТАМИНЫ Витамины, история открытия и изучения. Классификация витаминов. Причины недостаточности витаминов:экзогенные и эндогенные гипо- и авитаминозы. Гипервитаминозы и их причины. Водорастворимые витамины. Химическое строение, активные формы, роль водорастворимых витаминов в клетке, механизмы всасывания и выделения из организма. Антивитамины. Суточная потребность в витаминах. Содержаниевитаминов в пищевых источниках. ВВЕДЕНИЕ В МЕТАБОЛИЗМ Понятие о метаболизме, метаболических путях Формы метаболических путей. Методы исследования обмена веществ. Исследование на целом организме, органах, срезах, клеточных культурах. Гомогенаты тканей, фракционирование гомогенатов, субклеточные структуры. Выделение метаболитов и ферментов, определение последовательности превращений субстратов. Изотопные методы. Методы моделирования и синтеза. Схема катаболизма основных веществ - углеводов, жиров, белков. Понятие о специфических путях и центральном пути метаболизма. Цикл лимонной кислоты: последовательность реакций и характеристика ферментов. Связь с цепью переноса электронов и протонов. Механизмы регуляции цикла лимонной кислоты. Функции цикла лимонной кислоты. Понятие метаболон. Связь между анаболизмом и катаболизмом. ФЕРМЕНТАТИВНЫЙ КАТАЛИЗ Общие представления о катализе. Физический смысл константы скорости химической реакции (энергетическая диаграмма реакции, переходное состояние, энергия активации). Классификация каталитических механизмов (общий и специфический кислотно-основной катализ, ковалентный катализ, промежуточные соединения). Белки - биологические катализаторы. Уравнение Михаэлиса-Бриггса-Холдейна. Графические методы анализа ферментативных реакций. Физический смысл константы Михаэлиса. Максимальные скорости ферментативных реакций. Активность и числа оборотов ферментов. Специфичность ферментативного катализа. Ингибиторы 6 и активаторы ферментов. Обратимость ферментативного катализа. Кофакторы. Регулируемость ферментативного катализа. Изо- и аллостерическое связывание лигандов-регуляторов с белкомферментом. Кооперативные эффекты в ферментативном катализе. Изоферменты. Международная классификация ферментов. Катализ и проницаемость мембран. Химические механизмы ферментативного катализа (сериновые протеазы, пиридоксалевый катализ, карбоангидраза и др.). Специфическая локализация ферментов в клетке. БИОЛОГИЧЕСКИЕ МЕМБРАНЫ. Липосомы как модель биологических мембран. Физико-химические свойства двойной фосфолипидной мембраны (проницаемость, подвижность молекул фосфолипидов). Химическая гетерогенность фосфолипидов мембраны. Динамическая модель биологических мембран СингераНикольсона. Периферические и интегральные белки мембран. Двумерная диффузия белков в мембранах. Ассиметрия биологических мембран. Топография белков и липидных компонентов мембран. Каналы, поры, переносчики, рецепторы и избирательная проницаемость биологических мембран. БИОЛОГИЧЕСКОЕ ОКИСЛЕНИЕ. Эндергонические и экзергонические реакции в живой клетке. Понятие макроэрг. Окисление как основной путь получения энергии в живой клетке. Механизмы окисления – перенос электронов, присоединение кислорода к субстрату, дегидрирование. Дегидрогеназы, строение и роль коферментов дегидрогеназ. Цепи окислительных реакций. Строение митохондрий и структурная организация цепи переноса электронов и протонов. Полиферментные комплексы митохондрий и их строение. Механизмы образования АТФ в клетке. Субстратное фосфорилирование, окислительное фосфорилирование. Механизм окислительного фосфорилирования. Разобщение окислительного фосфорилирования и свойства разобщителей. Роль кислорода в процессах окисления в клетке. Оксидазы и оксигеназы. Активные формы кислорода и их роль в процессах окисления в клетке. ОСНОВЫ БИОЭНЕРГЕТИКИ Изменение свободной энергии и равновесие обратимых реакций. Сопряженные реакции. Ферменты-лигазы в качестве устройств, обеспечивающих сопряжение. Соединения с высоким потенциалом переноса групп. Концепция фосфорильного потенциала. АТР -универсальный источник энергии в биологических системах. Другие "богатые энергией" соединения (пирофосфат, креатинфосфат, фосфоенолпируват, ацилтиоэфиры, ацилфосфаты). Регулирование фосфорильного потенциала. Креатинкиназная и аденилаткиназная реакции. Нуклеозид моно-, ди- и трифосфат киназные реакции. Тепловые эффекты биохимических превращений и терморегуляция. Активный транспорт веществ через биологические мембраны. Транспортные АТРазы. ОБМЕН И ФУНКЦИИ УГЛЕВОДОВ Основные углеводы животных и их биологическая роль. Углеводы пищи. Потребность в углеводах, основные требования к углеводному составу продуктов питания. Пути использования глюкозы в клетке. Центральная реакция углеводного обмена. Анаэробный распад глюкозы (анаэробная дихотомия, гликолиз). Гликолитическая оксидоредукция; пируват как акцептор водорода. Субстратное фосфорилирование. Другие акцепторы водорода в анаэробных условиях, спиртовое, молочнокислое брожение и их роль. Структурная организация процессов гликолиза в клетке, регуляция анаэробной дихотомии. Энергетический выход анаэробного окисления глюкозы. Аэробный распад глюкозы. Общие реакции с гликолизом. Окислительное декарбоксилирование пирувата, понятие о полиферментных комплексах, пируватдегидрогеназа. Энергетический выход окисления глюкозы в аэробных условиях. Глюконеогенез, пути синтеза глюкозы в клетке. Ключевые ферменты глюконеогенеза. Регуляция глюконеогенеза. Пентозофосфатный путь окисления глюкозы (апотомия).Ферменты окислительного этапа. Значение окислительного этапа апотомии. Неокислительный этап пентозофосфатного пути, 7 основные ферменты. Связь с гликолизом. Распространение в клетке и биологическая роль. Регуляция процесса. Путь глюкуроновой кислоты. Основные реакции. Биологическая роль этого пути окисления глюкозы. Связь с пентозофосфатным путем и гликолизом. Свойства и распространение гликогена как резервного полисахарида. Биосинтез гликогена. Мобилизация гликогена. Роль адреналина в регуляции резервирования и мобилизации гликогена. Гликогенозы и агликогенозы. Обмен сахарозы, лактозы и мальтозы. Обмен фруктозы и галактозы Наследственные нарушения обмена моносахаридов и дисахаридов: галактоземия, фруктозурия, непереносимость дисахаридов. ОБМЕН И ФУНКЦИЯ ЛИПИДОВ Понятие липиды. Классификация. Омыляемые и неомыляемые липиды. Простые и сложные липиды. Липиды пищевых продуктов. Требования к липидному составу продуктов питания. Переваривание липидов. Нарушение переваривания и всасывания. Ресинтез липидов в клетках кишечника. Хиломикрон как транспортная форма экзогенных липидов. Ресинтез липидов в печени и образование ЛПОНП. Липопротеинлипаза и е роль в обмене липопротеинов крови. Внутриклеточный обмен липидов. Механизмы активирования жирных кислот. Транспорт жирных кислот в митохондрии. Роль карнитина в этом процессе. -окисление жирных кислот специфический путь катаболизма жирных кислот. Ферменты -окисления. Окисление жирных кислот с нечетным числом углеродных атомов. Связь -окисления с ферментами тканевого дыхания, энергетический выход окисления жирных кислот. Другие пути окисления жирных кислот и их значение. Пути использования активной уксусной кислоты. Биосинтез жирных кислот. Особенности строения синтетазы жирных кислот. Роль путей обмена глюкозы в синтезе жирных кислот. Высоконепредельные жирные кислоты - незаменимые факторы питания. Синтез оксиметилглутарил-КоА. Роль этого соединения. Механизмы синтеза кетоновых тел и их биологическая роль. Восстановление оксиметилглутарил-КоА (ОМГ) в мевалоновую кислоту. Представление о синтезе холестерола. Регуляция синтеза холестерола. Транспорт холестерола в крови, роль ЛПОНП, ЛПНП и ЛПВП в механизмах транспорта холестерола в организме. Превращение холестерола в желчные кислоты. Выведение холестерола из организма. Гиперхолестеролемия и ее причины. Желчекаменная болезнь. Биохимия атеросклероза, факторы риска. Биохимические основы лечения и профилактики гиперхолестеролемии и атеросклероза. Резервирование и мобилизация жиров в жировой ткани; регуляция мобилизации адреналином. Транспорт жирных кислот в крови. Роль резервирования и мобилизации жиров, нарушение этих процессов при ожирении. Фосфолипиды и гликолипиды. Общие представления о механизмах их синтеза и распада. Фосфолипазы. Функции фосфолипидов и гликолипидов, врожденные нарушения обмена этих соединений. ОБМЕН И ФУНКЦИИ АМИНОКИСЛОТ Пищевые белки как источник аминокислот. Требования к белковому питанию. Переваривание белков. Эндо- и экзопептидазы желудочно-кишечного тракта. Всасывание аминокислот. Пути использования аминокислотного фонда клетки. Механизмы катаболизма аминокислот. Трансаминирование, аминотрансферазы. Тканевая и внутриклеточная специфичность трансаминаз и ее значение. Прямое и непрямое дезаминирование аминокислот. Биологическая роль дезаминирования. Центральная роль глутаминовой кислоты в обмене аминокислот. Основные источники аммиака в организме. Пути использования и обезвреживания аммиака: восстановительное аминирование, синтез амидов дикарбоновых кислот, образование карбамоилфосфата. Глутаминаза почек и печени. Образование и выведение солей аммония. 8 Активация глутаминазы почек при ацидозе. Биосинтез мочевины, происхождение атомов азота мочевины. Нарушения синтеза и выведения мочевины. Другие азотсодержащие небелковые молекулы плазмы крови, значение определения содержания их в медицинской практике. Общие представления об азотистом балансе организма человека, положительный, отрицательный азотистый баланс, азотистое равновесие. Пути использования безазотистого остатка аминокислот: синтез новых аминокислот, образование глюкозы (глюкогенные аминокислоты), образование кетоновых тел (кетогенные аминокислоты), прямое окисление, превращение в липиды при нарушениях белкового питания. Роль отдельных аминокислот. Метионин и S-аденозилметионин, синтез креатина, адреналина, фосфатидов, метилирование ДНК, источник одноуглеродных групп. Липотропные факторы. Обмен тирозина и фенилаланина,нарушения обмена этих аминокислот: фенилкетонурия, алкаптонурия, альбинизм. Синтез гормонов, производных тирозина. Декарбоксилирование аминокислот. Биогенные амины, происхождение, функции. Окисление биогенных аминов. Аминоксидазы. ОБМЕН НУКЛЕОТИДОВ Нуклеопротеины. История открытия нуклеопротеинов. Нуклеиновые кислоты, различия между ДНК и РНК. Особенности первичной структуры нуклеиновых кислот. Связь между нуклеотидами. Вторичная структура нуклеиновых кислот: особенности вторичной структуры ДНК и РНК, типы связей, стабилизирующих вторичную структуру. Третичная структура, роль белков в организации пространственной структуры нуклеиновых кислот. Денатурация нуклеиновых кислот. Гибридизация ДНК-ДНК, ДНК-РНК. Методы исследования структуры нуклеиновых кислот. Строение рибосом. Полирибосомы. Информосома и матричная РНК, транспортная РНК, строение и функции. Строение хромосом. Распад нуклеиновых кислот. Нуклеазы желудочно-кишечного тракта. Распад пуриновых нуклеотидов, образование мочевой кислоты. Синтез пуриновых нуклеотидов. Субстраты синтеза, ключевые ферменты и регуляция синтеза пуриновых нуклеотидов. Распад пиримидиновых нуклеотидов до конечных продуктов. Представления о синтезе нуклеотидов: субстраты и ферменты синтеза. Повторное использование нуклеозидов для синтеза нуклеотидов. Нарушения обмена нуклеотидов. БИОСИНТЕЗ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ И БЕЛКОВ Синтез ДНК, субстраты, ферменты, условия синтеза. Репликация как способ передачи информации от матрицы к продукту реакции. Механизмы регуляции репликции. Обратная транскрипция, биологическая роль обратной транскрипции. Биосинтез РНК(транскрипция):субстраты, ферменты, условия транскрипции. Транскрипция как способ передачи информации от ДНК на РНК. Биосинтез рибосомных, транспортных и матричных РНК. Механизмы регуляции транскрипции. Биосинтез белков. Биологический (аминокислотный, нуклеотидный) код и его свойства. Адапторная роль транспортной РНК. Рекогниция. Биосинтез аминоацил-т РНК: субстратная специфичность аминоацил-тРНК-синтетаз. Механизмы и этапы трансляции. Регуляция трансляции. Универсальность биологического кода и механизма синтеза белков. Антибиотики-ингибиторы синтеза нуклеиновых кислот и белков. Процессинг нуклеиновых кислот и белков. Характер изменений строения нуклеиновых кислот и белков после их первичного синтеза. Распад клеточных белков и нуклеиновых кислот. Время биологического полураспада белков и нуклеиновых кислот. Ферменты, катализирующие процессы распада белков. Современные методы молекулярной биологии и их прикладное значение для медицины. Полимеразная реакция, клонирование, блот-анализ, выяснение последовательности нуклеотидов методом Сэнжера. РЕГУЛЯЦИИЯ ОБМЕНА ВЕЩЕСТВ. ГОРМОНЫ Основные механизмы регуляции метаболизма: изменение активности ферментов (активирование и ингибирование), изменения количества ферментов в клетке(индукция и 9 репрессия синтеза, изменение скорости разрушения ферментов), изменения проницаемости клеточных мембран. Гормональная регуляция как средство межклеточной и межорганной координации обмена веществ. Клетки-мишени и клеточные рецепторы гормонов. Классификация гормонов по химической структуре, по месту образования, по механизму действия. Особенности механизма действия гормонов белковой, пептидной и аминокислотной природы. Посредники в действии гормона на клетку: циклические пуриновые нуклеотиды, ионы кальция, продукты гидролиза фосфатидилинозитолов. Протеинкиназы, роль протеинкиназ в механизмах изменения активности ферментов. Механизм действия гормонов стероидной природы. Внутриклеточные рецепторы. Влияние на синтез белков. Строение, механизм действия и влияние на обмен веществ важнейших гормонов. Нарушения функции эндокринных желез: гипер- и гипопродукция гормонов. Общие принципы лечения таких состояний. Простагландины и их роль в регуляции метаболизма и физиологических функций. ОБМЕН ВОДЫ И МИНЕРАЛЬНЫХ СОЛЕЙ Минеральные вещества тканей человека. Классификация. Пути поступления минеральных веществ в организм, механизмы всасывания. Функции минеральных веществ. Электролитный состав биологических жидкостей. Механизмы регуляции объема, электролитного состава и pН жидкостей организма. Роль почек, желудочно-кишечного тракта, кожи, легких в регуляции водносолевого обмена. Условия и механизмы возникновения ацидоза, алкалоза, обезвоживания и отеков. Обмен натрия и калия. Особенности распределения в организме. Регуляция обмена. Обмен фосфора и кальция. Потребность в кальции и фосфоре. Механизмы всасывания. Распределение в организме. Регуляция обмена. Микроэлементы. Биологическая роль железа, меди, кобальта, йода, магния. Обмен микроэлементов в организме. МЕТАБОЛИЗМ (ДИНАМИЧЕСКАЯ БИОХИМИЯ) Аутотрофия, гетеротрофия. Фотосинтез. Полисахариды и нейтральные жиры как запасные вещества клетки. Аэробный и анаэробный обмен веществ. Конечные продукты метаболизма. Энергетическая и пластическая функции обмена веществ. 1.Обмен углеводов Фосфоролиз гликогена. Гидролиз крахмала. Гексокиназная и глюкокиназная реакции. Прямое окисление глюкозы. Включение гексоз и пентоз в гликолитический распад. Молочнокислое и спиртовое брожение. Стехиометрические уравнения гликолиза и гликогенолиза. Образование АТР, сопряженное с распадом глюкозо-6-фосфата до молочной кислоты. Регулирование гликолиза. Регуляторные механизмы фосфоролизад гликогена и фосфофруктокиназной реакции. Обратимость гликолиза и глюконеогенез. Цикл Кори. Синтез гликогена. Стехиометрические уравнения синтеза глюкозы и гликогена из молочной кислоты. Содержание глюкозы, лактата и пирувата в крови как физиологический показатель. 2.Обмен липидов Транспорт липофильных веществ: желудочно-кишечный тракт - кровь - клетки. Липазы и фосфолипазы. Включение глицерина в гликолитические реакции. Активация жирных кислот. Роль карнитина в транспорте жирных кислот в митохондрии. Окислительный распад жирных кислот (окисление). Конечные продукты распада "четных" и "нечетных" жирных кислот. Содержание "кетоновых" тел {ацетоацетат, ацетон, -оксибутират} как физиологический показатель. Источники ацетил-СоА для синтеза жирных кислот. Синтез фосфолипидов. Синтез нейтрального жира. Стехиометрические уравнения распада жирных кислот до ацетил-СоА и синтеза жирных кислот из ацетил-СоА. 3.Обмен аминокислот и других азотистых соединений. Внеклеточный (пищеварительный) протеолиз. Заменимые и незаменимые аминокислоты. Переаминирование. Декарбоксилирование аминокислот. Окислительное дезаминирование аминокислот. -Кетокислоты – продукты распада аминокислот. Детоксикация аммиака. 10 Аммониотелия, уреотелия и урикотелия. Синтез мочевины в качестве конечного продукта обмена азотистых соединений. Стехиометрические уравнения образования мочевины. Конечные продукты и схемы распада пуриновых и пиримидиновых оснований. Глутамин как транспортная форма аммиака. Креатин и креатинин. Внутриклеточный протеолиз. Общие представления о синтезе заменимых аминокислот. Активация аминокислот и синтез аминоацил-t-РНК. Общие представления о синтезе белка рибосомами. 4.Распад ди-, трикарбоновых кислот. Окислительное декарбоксилирование пирувата. Ацетил-СоА - универсальный интермедиат распада жиров, углеводов и белков. Пути образования щавелевоуксусной кислоты. Цикл ди-, трикарбоновых кислот (цикл Кребса). Стехиометрическое уравнение распада пирувата до СО2. Энергетическая и пластическая функции цикла Кребса. 5.Терминальное окисление Коферменты - продукты окислительных реакций (NAD+/NADH; NADF+/NADPН; убихинон/убихинол). Оксидазы и механизмы активации кислорода. Электрон-трансферазные реакции и понятие о дыхательных цепях. Структура митохондрий и локализация компонентов дыхательной цепи млекопитающих. Перенос восстановительных эквивалентов через мембрану митохондрий. Трансгидрогеназная реакция. Компоненты дыхательной цепи. Дыхательная цепь - преобразователь энергии (теория электрохемического сопряжения П. Митчела). Обратимая Н+-АТРаза -главное устройство для синтеза АТР в аэробных клетках. Стехиометрические уравнения окисления NADН и убихинола кислородом. Эффективность сопряжения окислительного фосфорилирования. Механизмы термогенеза. Дыхательные цепи микросом. Цитохром Р-450 и окислительная деструкция ксенобиотиков. РЕГУЛИРОВАНИЕ И ИНТЕГРАЦИЯ МЕТАБОЛИЗМА Ключевые пары метаболитов (NAD(Р)+/NAD(Р)Н; АТР/АDР; Ацил-СоА/СоА; лактат/пируват; D-оксибутират/ацетоацетат) и факторы, влияющие на их концентрации. Дивергенция катаболических и анаболических цепей метаболизма. Типы регулирования активности ферментов и переносчиков. Стехиометрическое регулирование (алло- и изостерические ингибиторы и активаторы ферментов). Регулирование активности ферментов их ковалентной модификацией: фосфорилирование, ацилирование, АОР-рибозилирование. Протеинкиназы и протеинфосфатазы. Каскадный принцип регулирования ферментов. Гормоны в качестве первичных управляющих сигналов метаболизма. Рецепторы гормонов и С-белки. Механизмы и результаты действия инсулина, адреналина, глюкагона. Вторичные посредники передачи сигналов: циклические нуклеотиды, ионы Са+2, фосфатидилинозитол. Внутриклеточный протеолиз. Тканевая специфичность метаболизма. БИОХИМИЯ ПЕЧЕНИ Роль печени в обмене углеводов, липидов, аминокислот. Синтез белков плазмы в печени. Реакции обезвреживания веществ в печени. Роль микросомального окисления в реакциях обезвреживания. Активная глюкуроновая и серная кислоты в реакциях обезвреживания. Роль печени в обмене гема. Реакции синтеза гема, субстраты, ферменты. Реакции распада гема, 'прямой' и 'непрямой' билирубин. Нарушения обмена билирубина Желтухи: гемолитическая, обтурационная, паренхиматозная. Желтуха новорожденных. Желчные пигменты крови, кишечника, мочи. Реакции обезвреживания продуктов гниения, поступающих из кишечника. Биохимические механизмы развития печеночно-клеточной недостаточности и печеночной комы. Биохимические методы диагностики нарушений функции печени. БИОХИМИЯ КРОВИ Форменные элементы крови. Особенности химического состава и строения эритроцитов. Разновидности и производные гемоглобина. Транспорт кислорода и двуокиси углерода в крови. Особенности насыщения гемоглобина кислородом и угарным газом. Гемоглобинопатии. Гипоксии. Лейкоциты, особенности строения и химического состава. Роль лейкоцитов. Плазма крови и сыворотка. Белки плазмы крови. Классификация по функциям белков крови: транспортные белки, белки системы комплемента, кининовой системы, свертывания, 11 фибринолиза, иммуноглобулины, белки-ингибиторы протеолиза. Белки плазмы - источник аминокислот при голодании. Свертывание крови. Сосудисто-тромбоцитарный и коагуляционный гемостаз. Роль тромбоцитов в процессах гемостаза. Внутренняя и внешняя системы коагуляционного гемостаза. Фазы. Каскадный механизм активирования ферментов, участвующих в свертывании крови. Роль витамина К в свертывании крови. Противосвертывающие системы. Представление о гемофилиях и тромбозах. Значение биохимического анализа крови в характеристике состояния здоровья человека. БИОХИМИЯ СОЕДИНИТЕЛЬНОЙ ТКАНИ Клетки соединительной ткани, особенности метаболизма. Химический состав межклеточного вещества. Коллаген, особенности синтеза и распада. Эластин, особенности обмена. Белково-углеводные комплексы. Классификация. Протеогликаны, гликозаминогликаны, гликопротеины. Особенности синтеза и распада. Роль в организме. Изменения соединительной ткани при старении. Влияние питания на обмен соединительной ткани. БИОХИМИЯ МЫШЦ Белки миофибрил. Особенности аминокислотного состава. Молекулярная структура миофибрилл. Биохимические механизмы мышечного сокращения и расслабления. Роль ионов в регуляции мышечного сокращения. Белки саркоплазмы, отдельные представители, их строение и функции. Экстрактивные вещества мыщц. Особенности энергетического обмена в мышцах. Креатинфосфокиназа и ее изоферменты. Белки мышц в питании человека. Полноценность белков мышц. БИОХИМИЯ НЕРВНОЙ СИСТЕМЫ Химический состав нервной ткани. Миелиновые мембраны: особенности состава и структуры. Особенности энергетического обмена в нервной ткани, роль аэробного распада глюкозы. Молекулярные механизмы синаптической передачи. Медиаторы, механизмы синтеза и распада медиаторов. Роль биогенных аминов. Активные пептиды мозга. БИОХИМИЯ ПИТАНИЯ И ПИЩЕВАРЕНИЯ Потребность человека в энергии. Суточный баланс энергии: основной обмен, термогенез, расходы на физическую активность. Незаменимые факторы питания. Основные требования к аминокислотному составу белков. Потребность в липидах. Незаменимые жирные кислоты и их роль в организме. Проявления недостаточности незаменимых жирных кислот. Потребность в углеводах. Последствия преимущественного использования углеводов в питании. Роль дисахаридов в питании. Витамины и минеральные вещества в питании. Жирорастворимые витамины и их роль в организме. Патологические состояния, связанные с нарушением питания. Ожирение, атеросклероз, диабет, квашиоркор, маразм, гипо-,гипер- и авитаминоэы. Голодание и его влияние на организм. Влияние питания на процессы синтеза белков и нуклеиновых кислот. Механизмы переваривания веществ в желудочно-кишечном тракте. Слюна, желудочный сок, кишечный сок, сок поджелудочной железы, химический состав. Механизмы переваривания веществ в кишечнике. Толстый кишечник. Основные биохимические процессы, протекающие в толстом кишечнике. Гниение белков. Процессы обезвреживания продуктов гниения. Микрофлора кишечника - важный источник витаминов для человека. Специалист должен знать: а) Молекулярные основы процессов жизнедеятельности: метаболизм белков, липидов, углеводов, минеральных веществ, влияние незаменимых факторов питания на состояние здоровья человека; б) Основы регуляции процессов жизнедеятельности: молекулярные механизмы действия гормонов, медиаторов и других молекул - регуляторов на уровне химических реакций, катализируемых ферментами, на уровне субклеточных частиц, клеток, органов и целого организма; в) Молекулярные механизмы обезвреживания ксенобиотиков, действия физических факторов и защиты организма от их действия. 12 Специалист должен уметь: квалифицированно назначать биохимические экспертные санитарно-гигиенические исследования и интерпретировать их результаты пользоваться биохимическими экспресс - методами диагностики заболеваний. Специалист должен иметь навыки: биохимического исследования биологического материала (моча, слюна, кровь, желчь, панкреатический сок), пищевых продуктов применения лабораторных технологий МАЛЫЙ ПРАКТИКУМ 1. Свойства растворов электролитов. рН растворов и буферная емкость. Способы выражения концентраций. 2. Методы определения рН. рН-чувствительные индикаторы. Стеклянный электрод. 3. Свойства белков и аминокислот. Ионообменная хроматография смесей аминокислот. Определение изоэлектрической точки белков. 4. Качественные реакции аминокислот, пептидов и белков. 5. Количественное определение белков. 6. Фракционирование и очистка белков, 7. Анализ состава нуклеопротеидов дрожжей. 8. Качественные и количественные реакции углеводов. 9. Определение активности ферментов, 10. Ферментативные превращения углеводов. Определение сахара в крови. 11. Разделение и идентификация липидов в экстрактах ткани мозга. 12. Ферментативный гидролиз жира молока. 13. Определение содержания креатинфосфата в мышечной ткани. 14. Определение содержания нуклеиновых кислот в ткани печени. Выделение ДНК и ее количественное определение. 15. Определение активности гликогенфосфорилазы мышц. 16. Получение препаратов лактатдегидрогеназы из различных тканей. Определение активности фермента и изучение изозимов лактатдегидрогеназы. 17. Переаминирование в печени и мышцах. Разделение и количественное определение аминокислот. ЛИТЕРАТУРА основная: 1. А. Ленинджер. Основы биохимии. В 3-х томах. "Мир", М., 1985. 2. Л. Страйер. Биохимия. В 3-х томах. "Мир", М., 1984. 3. Р. Марри, Д. Греннер, П. Мейес, В. Родуэлл. Биохимия человека. В 2-х томах. "Мир", М., 1993 Г. 4. Малер, Ю. Кордес. Основы биологической химии. "Мир", М., 1970. 5. Березов Т.Т., Коровкин Б.Ф., Биологическая химия, М.,1998; 6. Николаев А.Я., Биологическая химия, М.,1989; 7. Строев Е.А. Биологическая химия, М.,1986; 8. Мецлер Д. Биохимия (в трех томах), М.,"Мир",1980; 9. Уайт А.,Хендлер Ф.,Смит Э. и др, Основы биохимии(в трех томах), М.,"Мир",1981; дополнитекльная 1. М.Диксон, Э. Уэбб. Ферменты, В 3-х томах. "Мир", М., 1982. 2. Э. Корниш-Боуден. Основы ферментативной кинетики. "Мир", М., 1979. 3. Ч. Кинпюр, П. Шиммел. Биофизическая химия. В 3-х томах. "Мир", М 4. В. Дженкс. Катализ в химии и энзимологии. "Мир". М., 197.2. 5. В.П. Скулачев. Биоэнергетика. Мембранные преобразователи энергии "Высш. шк.", М., 1989. П. 6. Хочачка, Дж. Семеро. Биохимическая адаптации. "Мир", М., 1988. 13