Красикова Алла Валерьевна МК-1677.2009.4 Особенности

Аннотация научного отчета за 2010 год
по гранту Президента Российской Федерации для поддержки молодых российских ученых
– кандидатов наук и докторов наук № МК-1677.2009.4
«Особенности функционирования и закономерности транскрипции некодирующей ДНК в
ядрах растущих ооцитов доместицированных видов птиц»,
руководитель А.В. Красикова
1. Полученные за отчетный период научные (научно-технические) результаты
Прведен анализ закономерностей транскрипции некодирующей белки ДНК в ядрах
ооцитов птиц, особенностей функционирования синтезируемых транскриптов, котранскрипционных этапов процессинга продуктов транскрипции сателлитной ДНК. С
помощью биоинформатического анализа расшифрованных последовательностей генома
курицы (Chicken genome Project) идентифицирован новый тандемный повтор, который
назван LL2R («lumpy loop 2 repeat»); обнаружена транскрипция повтора LL2R в ходе
оогенеза. Высокоточное физическое картирование повтора LL2R на гигантских
хромосомах типа ламповых щеток позволило определить природу некодирующих
транкскриптов, содержащихся в «особых» петлях, аккумулирующих факторы сплайсинга
РНК (белок SC35, зрелые малые ядерные РНК). Картированы новые центромерные
сателлитные повторы ДНК хромосом GGA1, GGA2 и GGA4 домашней курицы,
продемонстрировано отсутствие транскриптов этих повторов на хромосомах типа
ламповых щеток. Проведен анализ транскриптома в ядрах ооцитов домашней курицы и
японского перепела с использованием методов микрохирургического отделения ядер
ооцитов от ооплазмы, выделения низкомолекулярной РНК и электрофоретического
разделения РНК в денатурирующем ПАА-геле. Охарактеризован профиль экспрессии
коротких регуляторных РНК (размером от 15 до 50 н.) на разных этапах роста ооцита у
домашних видов птиц.
2. Основные публикации за отчетный период
По результатам исследования в 2010 г. опубликовано 13 печатных работ, в том числе
4 статьи в реферируемых журналах.
Статьи:
1. Красикова А.В., Гагинская Е.Р. Организация центромерных районов хромосом на
стадии ламповых щеток. Цитология (РАН), 2010, том 52, №7, с. 515-533.
2. A. Zlotina, S. Galkina, A. Krasikova, R. P.M.A. Crooijmans, M. A.M. Groenen, E.
Gaginskaya, S. Deryusheva. Precise centromere positioning on chicken chromosome 3.
Cytogenetics and Genome Research, 2010, 129(4): p. 310-313.
3. А.А. Дакс, С.Е. Дерюшева, А.В. Красикова, А.М. Злотина, Е.Р. Гагинская, С.А.
Галкина. Хромосомы-ламповые щётки японского перепела Coturnix coturnix
Japonica: новая версия цитогенетических карт. Генетика (РАН) 2010, том 46, № 10,
с. 1335–1338. [Англ. версия: A.A. Daks, S.E. Deryusheva, A.V. Krasikova, A.M.
Zlotina, E.R. Gaginskaya, S.A. Galkina. Lampbrush chromosomes of the Japanese quail
(Coturnix coturnix japonica): A new version of cytogenetic maps. Russian Journal of
Genetics, 2010, 46(10): p. 1178-1181.]
4. А.В. Красикова, Е.В. Василевская, Е.Р. Гагинская. Хромосомы типа ламповых
щёток
домашней
курицы:
транскрипция
тандемно
повторяющихся
последовательностей ДНК. Генетика (РАН), 2010, том 46, № 10, с. 1329–1334.
[Англ. версия: Krasikova A.V., Vasilevskaya E.V., Gaginskaya E.R. Chicken
Lampbrush chromosomes: Transcription of Tandemly Repetitive DNA Sequences.
Russian Journal of Genetics, 2010, 46(10): p. 1173–1177.]
3. Участие в научных конференциях и совещаниях по тематике проводимых
исследований
Результаты исследования были представлены на LXXV Международном Симпозиуме по
колличественной биологии в Колд-Спринг-Харбор «Nuclear Organization and Function»
(г. Нью-Йорк, США, 2-7 июня 2010 г.), на 19ом Международном Коллоквиуме по
цитогенетике животных и геномному картированию (г. Краков, Польша, 6-9 июня 2010 г.),
на Международном Симпозиуме EMBO/EMBL «Non-Coding Genome» (г. Гейдельберг,
Германия, 13-16 октября 2010 г.), на четвертой Международной конференции
«Современные достижения бионаноскопии» – устный доклад (г. Москва, 15-18 июня 2010
г.), на ХVI Всероссийским симпозиуме «Структура и функции клеточного ядра» (г. СанктПетербург, 5-7 октября 2010 г.).
4. Научно-педагогическая деятельность
- Практические занятия по дисциплине «Практикум по структурному и молекулярному
анализу биологических систем» (осенний семестр) для студентов, обучающихся по
магистерской программе «Биология клетки».