МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ВЕЛОГЕННЫХ ШТАММОВ ВИРУСА БОЛЕЗНИ НЬЮКАСЛА, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ КАЗАХСТАНА В 1998 ГОДУ А.П.Богоявленский, С.В.Левандовская, И.С.Коротецкий, А.Г.Прилипов, О.В.Ляпина, Е.В.Усачев, В.П.Толмачева, Э.С.Омиртаева, К.Д.Даулбаева, И.Ш.Бутакова, Т.С.Богомолова, В.Э.Березин Институт микробиологии и вирусологии МОН РК, Алматы, Казахстан; Институт вирусологии им. Д.И.Ивановского РАМН, Москва, Россия Структура генома вируса болезни Ньюкасла Подбор праймеров на участке фрагмента гена F Патогенные штаммы вируса болезни Ньюкасла, выделенные на территории Казахстана в 1998 году NN Isolate identification NDV strain Year of isolation 1 APMV-1/chicken/Almaty/22/98 KAZ-22-98 1998 2 APMV-1/chicken/Almaty/26/98 KAZ-26-98 1998 3 APMV-1/chicken/Almaty/28/98 KAZ-28-98 1998 4 APMV-1/chicken/Almaty/30/98 KAZ-30-98 1998 5 APMV-1/chicken/Almaty/31/98 KAZ-31-98 1998 6 APMV-1/chicken/Almaty/34/98 KAZ-34-98 1998 7 APMV-1/chicken/Almaty/36/98 KAZ-36-98 1998 8 APMV-1/chicken/Almaty/38/98 KAZ-38-98 1998 9 APMV-1/chicken/Almaty/39/98 KAZ-39-98 1998 10 APMV-1/chicken/Almaty/43/98 KAZ-43-98 1998 Патогенные свойства исследованных штаммов ВБН Штамм Хозяин ИЦИП СВГ Аминокислотная последовательность сайта расщепления APMV-1/chicken/Almaty/22/98 fowl 1,64 54,2 112 RRQRR116 * F117 APMV-1/chicken/Almaty/26/98 fowl 1,05 85,6 112 RRQRR116 * F117 APMV-1/chicken/Almaty/28/98 fowl 1,68 51,4 112 RRQRR116 * F117 APMV-1/chicken/Almaty/30/98 fowl 1,58 60,0 112 RRQRR116 * F117 APMV-1/chicken/Almaty/31/98 fowl 1,61 54,9 112 RRQRR116 * F117 APMV-1/chicken/Almaty/34/98 fowl 1,78 56 112 RRQRR116 * F117 APMV-1/chicken/Almaty/36/98 fowl 1,58 59,2 112 RRQRR116 * F117 APMV-1/chicken/Almaty/38/98 fowl 1,87 62,4 112 RRQRR116 * F117 APMV-1/chicken/Almaty/39/98 fowl 1,42 70,4 112 RRQRR116 * F117 APMV-1/chicken/Almaty/43/98 fowl 1,56 58,8 112 RRQRR116 * F117 Филогенетическое дерево различных генотипов ВБН по фрагменту гена F Филогенетическое дерево VII генотипа ВБН по фрагменту гена F (47-421) Аминокислотная последовательность фрагмента гена F штаммов ВБН, принадлежащих к различным субгенотипам VII генотипа Genotypes, acids Majority amino 5 9 10 13 19 23 28 63 93 101 104 107 109 112 113 114 115 121 S I P L I L L V T R G S S R R Q K I VIIa P T -/R V VIIb P V S -/K V KAZ-22-98 P F S R V KAZ-26-98 P F S R V KAZ-28-98 P F S R V KAZ-30-98 P F S R V KAZ-31-98 P F S R V KAZ-43-98 P F S R V KAZ-34-98 P F S R V KAZ-36-98 P F S R V KAZ-38-98 P F S R V KAZ-39-98 P F S R V VIIc P K V VIId P VIIe P S K P K -/P P K V K V Спасибо за внимание!