Предшественник Института России и Восточной Европы, Институт Советского Союза, был основан в 1947 году с целью развивать культурные и научные связи между Финляндией и тогдашним Советским Союзом. Название института сменилось осенью 1992 года после развала СССР, когда был принят закон о Институте России и Восточной Европы. Институт Советского Союза был создан как научно-исследовательский отдел, который занимался многими вопросами, связанными с русским языком, культурой и историей. Для поддержки труда научных работников в 1949 году была открыта библиотека. С середины 1960 годов в Институте Советского Союза начали формировать новый отдел, который должен был отвечать за развитие просветительских отношений между Финляндией и Советским Союзом. В 1970 годах институт начал координировать заключенные масштабные договоры о сотрудничестве между ВУЗами двух стран. Кроме этого стали осуществляться культурные проекты. В 2001 году правительство утвердило новое положение о Институте России и Восточной Европы, согласно которому в задачи Института стало входить в том числе и культурное сотрудничество, касающееся России и Восточной Европы, содержание библиотеки и связанное с ней информационное обслуживание, а также поддержание контактов с отечественными и зарубежными лицами и организациями. В связи с изменившимися окружающими условиями, а также c произошедшими во время рассмотрения бюджета в 2006 и 2007 годах изменениями условий деятельности института в 2005 году Министерство образования пригласило эксперта для выяснения и оценки необходимости развития Института России и Восточной Европы. Целью являлось развитие деятельности института для ее соответствия вызовам нового времени. Исследовательская работа была завершена в начале 2007 года. В результате проведенной работы институт обрел новую миссию, видение и стратегию, к реализации которых приступили в январе 2008 года. Исследовательские работы касательно Института России и Восточной Европы (на финском): Исследование Института России и Восточной Европы - Заметки и исследования рабочей группы Министерства образования 2007:24 Предложение о преобразовании института в Центр, а также исследование, касающееся положения и задач Института России и Восточной Европы - Заметки и исследования рабочей группы Министерства образования и культуры 2012:1 Предложение о преобразовании Института в Фонд, а также промежуточный отчет рабочей группы о подготовке работы по преобразованию Института России и Восточной Европы в Фонд - Заметки и исследования рабочей группы Министерства образования и культуры 2012:17 Предложение о преобразовании Института в Фонд, а также окончательный отчет рабочей группы о подготовке работы по преобразованию Института России и Восточной Европы в Фонд - Заметки и исследования рабочей группы Министерства образования и культуры 2012:23