Некрасова О.В. - Институт биоорганической химии

Сведения о научной работе Некрасовой О.В.
Публикации в рецензируемых журналах
1. Kuzmenkov AI, Vassilevski AA, Kudryashova KS, Nekrasova OV, Peigneur S, Tytgat
J, Feofanov AV, Kirpichnikov MP, Grishin EV. Variability of Potassium Channel
Blockers in Mesobuthus eupeus Scorpion Venom with Focus on Kv1.1: an Integrated
Transcriptomic and Proteomic Study. J Biol Chem. 2015 pii:jbc.M115.637611.
2. Anh H.N., Hoang V.D.M., Nguyen N.P., Kudryashova K.S., Nekrasova O.V., Feofanov A.V.,
Kirpichnikov M.P., Andreeva T.V., Serebryakova M.V., Tsetlin V.I., Utkin Y.N. Vietnamese
Heterometruslaoticus scorpion venom: evidence for analgesic and anti-inflammatory activity and
isolation of new polypeptide toxin acting on Kv1.3 potassium channel. Toxicon, 2014, 77:40-48.
3. Хоанг А.Н., Во Х.Д., Кудряшова К.С., Некрасова О.В., Феофанов А.В., Андреева Т.В.,
Цетлин В.И., Уткин Ю.Н. Новый токсин хетлаксин из яда скорпиона Heterometrus laoticus
взаимодействует с потенциал-зависимым калиевым каналом Kv1.3. ДАН, Биохимия,
Биофизика, Молекулярная биология. 2013, Т. 449, С. 109-111.
4. Kudryashova K.S., Nekrasova O.V., Kuzmenkov A.I., Vassilevski A.A., Ignatova
A.A.,Korolkova Yu.V., Grishin E.V., Kirpichnikov M.P., Feofanov A.V. Fluorescent system based
on bacterial expression of hybrid KcsA channels is designed for Kv1.3 ligand screening and study.
Anal. Bioanal. Chem., 2013, 405:2379-2389.
5. Shenkarev ZO, Lyukmanova EN, Butenko IO, Petrovskaya LE, Paramonov AS,
Shulepko MA, Nekrasova OV, Kirpichnikov MP, Arseniev AS. Lipid-protein nanodiscs
promote in vitro folding of transmembrane domains of multi-helical and multimeric
membrane proteins. Biochim Biophys Acta. 2013, 1828:776-784.
6. Некрасова О.В., Шаронов Г.В., Тихонов Р.В., Колосов П.М., Астапова М.В., Якимов С.А.,
Тагвей А.И., Корчагина А.А., Бочарова О.В., Вульфсон А.Н., Феофанов А.В., Кирпичников
М.П. Рецептор-связывающий домен эфрина А1: получение в бактериальной системе
экспрессии и активность. Биохимия. 2012 Т.77, с.1387-1394.
7. Nekrasova OV, Wulfson AN, Tikhonov RV, Yakimov SA, Simonova TN, Tagvey AI, Dolgikh
DA, Ostrovsky MA, Kirpichnikov MP. A new hybrid protein for production of recombinant
bacteriorhodopsin in Escherichia coli. J Biotechnol. 2010, 147:145-150.
Статьи в научных сборниках и периодических научных изданиях
1. Feofanov, A.V., Kudryashova, K.S., Nekrasova O.V., Vassilevski A.A., Kuzmenkov A.I.,
Korolkova Y.V., Grishin E.V., and Kirpichnikov, M.P. Quantitative confocal microscopy analysis
as a basis for search and study of potassium Kv1.x channel blockers. (2015) Springer Proceedings
Phys., Vol. 164, E.K. Polychroniadis et al. (Eds): 2nd International Multidisciplinary Microscopy
and Microanalysis Congress, chapter 32, in press. ISBN:978-3-319-16918-7; Chapter DOI
10.1007/978-3-319-16919-4_32
2. Pechkova Eu., Ostrovsky M., Nekrasova O., Shebanova A., Sivozhelezov V., Kirpichnikov M.,
Nicolini C. Octopus Rhodopsin for Nanobioelectronics February. In: "Nanobiotechnology in
Energy, Environment and Electronics: Methods and Applications". Edited by C. Nocolini in the
series , 2015, Boca Raton, FL., USA, CRC Press, pp. 317-362. ISBN 978-9-814-46396-6.
3. Островский М.А., Фельдман Т.Б., Яковлева М.А., Ловягина Е.Р., Чуркина Л.А.,
Кирпичников М.П., Долгих Д.А., Некрасова О.В.,Коршун В.А., Тахчиди Х.П., Борзенок С.А.,
Шурыгина М.Ф., Гинтер Е.К., Хлебникова О.В., Поляков А.В. Зрительный цикл, белок
ABCR4 и моногенное заболевание сетчатки - болезнь Штаргардта (методы генной
диагностики) в сборнике "Постгеномные исследования и технологии" под. ред.
С.Д.Варфоломеева, 2011, Макс-Пресс, Москва, с. 376-422. ISBN 978-5-317-03968-4.
Публикации в материалах научных мероприятий
1. Kudryashova K., Kuzmenkov A., Nekrasova O., Feofanov A., Grishin E., Vassilevski A. Novel
Kv1.3 blockers for the treatment of autoimmune diseases. FEBS EMBO 2014 Conference (30
August – 4 September 2014, Paris, France); FEBS J., 2014, 281, Sup. 1, p. 149.
2. Kuzmenkov A., Vassilevski A., Kudryashova K., Nekrasova O., Feofanov A., Kirpichnikov
M.P., Grishin E. Structure and function of a sodium channel gating modifier from the crab spider
Heriaeus melloteei. FEBS EMBO 2014 Conference (30 August – 4 September 2014, Paris, France);
the FEBS Journal, 281, supplement 1, p. 387.
3. Feofanov, A.V., Kudryashova, K.S., Nekrasova O.V., Vassilevski A.A., Kuzmenkov A.I.,
Korolkova Y.V., Grishin E.V., and Kirpichnikov, M.P. Quantitative confocal microscopy analysis
as a basis for search and study of potassium Kv1.x channel blockers. In: Book of Abstracts
INTERM2014 (The 2nd International Multidisciplinary Microscopy Congress), Eds. E.K.
Polychroniadis, A.Y. Oral, M. Ozer, 2014, P. 87.
4. Feofanov, A.V., Kudryashova, K.S., Nekrasova O.V., Vassilevski A.A., Kuzmenkov A.I.,
Korolkova Y.V., Grishin E.V., and Kirpichnikov, M.P. Combining fluorescence microscopy and
bioengineering approach to discover new potassium Kv1.x channel blockers. In: 1st International
Caparica Conference on Chromogenic and Emissive Materials. Book of abstracts. 2014, P.131-132.
5. Ляпина Е.А., Некрасова О.В., Кудряшова К.С., Королькова Ю.В., Василевский А.А.,
Кузьменков А.И., Феофанов А.В. Биоинженерная клеточная система для поиска
высокоаффинных блокаторов калиевого канала Kv1.6. ActaNaturae, 2014, специальный
выпуск №1, с. 35.
6. Кудряшова К.С., Некрасова О.В., Королькова Ю.В., Феофанов А.В. Исследование
блокаторов каналов Kv1 с применением новых биоинженерных клеточных систем.
ActaNaturae, 2014, специальный выпуск №1, с. 32.
7. Ляпина Е.А., Некрасова О.В., Кудряшова К.С., Феофанов А.В. Контроль эффективности
встраивания рекомбинантного белка в цитоплазматическую мембрану E.coli с помощью
метода флуоресцентной детекции. XXVI Зимняя молодежная научная школа
"Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии" (Москва, 1014 февраля 2014 г.) Сборник тезисов, с. 67.
8. Кузьменков А.И., Василевский А.А., Кудряшова К.С., Некрасова О.В., Феофанов А.В.,
Кирпичников М.П. Разнообразие блокаторов калиевых каналов в яде скорпиона
Mesobuthuseupeus. XXVI Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления
физико-химической биологии и биотехнологии", (Москва, 10-14 февраля 2014 г.) Сборник
тезисов, с. 92.
2
9. Kudryashova K.S., Nekrasova O.V., Kuzmenkov A.I., Vassilevski A.A., Feofanov A.V. A novel
fluorescence system for potassium channel Kv1.1 and Kv1.3 ligand screening. 9-й Европейский
биофизический Конгресс (EBSA) (Португалия, г. Лиссабон, 13-17 июля 2013 г.) Eur.Biophys.
J. 2013, v. 42 (Suppl.1) p. S81.
10. Кузьменков А.И., Кудряшова К.С., Василевский А.А., Королькова Ю.В., Некрасова О.В.,
Феофанов А.В., Кирпичников М.П., Гришин Е.В. Поиск и идентификация лигандов
калиевых каналов Kv1.1 и Kv1.3 в яде паукообразных. VI Российский симпозиум "Белки и
пептиды" (г.Уфа, 11-15 июня 2013 г.) Сборник тезисов. стр. 210.
11. A.I. Kuzmenkov, A.A. Vassilevski, K.S. Kudryashova, O.V. Nekrasova, A.V. Feofanov, M.P.
Kirpichnikov, E.V. Grishin, Variability of potassium channel blockers in Mesobuthus eupeus
scorpion. Международная школа Wellcome Trust Advanced Course: Proteomics Bioinformatics
(Hinxton, Cambridge, UK, 11-15 November 2013).
12. Nekrasova O.V., Kudryasova K.S., Vassilevski A.A., Kuzmenkov A.I., Korolkova Y.V.,
Grishin E.V., Kirpichnikov M.P., Feofanov A.V. Functional expression of ligand-binding domains
of eukaryotic proteins in E.coli membrane: exercises with Kv1.3 channel. 38-ой Конгресс ФЕБО
(г.Санкт-Петербург, 6-11 июля 2013 г.) FEBS J. 2013, v.280 (Suppl.1), p. 610.
13. Некрасова О.В., Кудряшова К.С., Василевский А.А., Королькова Ю.В., Кузьменков А.И.,
Уткин Ю.Н., Гришин Е.В., Феофанов А.В., Кирпичников М.П. Новая биоинженерная
система для поиска и изучения пептидных блокаторов калиевых каналов Kv1.3 и Kv1.1. VI
Российский симпозиум "Белки и пептиды" (г.Уфа, 11-15 июня 2013 г.) Сборник тезисов. C.
121.
14. Кузьменков А.И., Кудряшова К.С., Василевский А.А., Королькова Ю.В., Некрасова О.В.,
Феофанов А.В., Гришин Е.В. Идентификация лигандов калиевого канала Kv1.3 в яде черного
скорпиона Orthochirus scrobiculosus. 16-я Международная Пущинская школа-конференция
молодых ученых «Биология – наука XXI века» (Пущино, 16-21 апреля 2012); Сборник
тезисов, стр. 179.
15. Кузьменков А.И., Кудряшова К.С., Василевский А.А., Королькова Ю.В., Некрасова О.В.,
Феофанов А.В., Кирпичников М.П., Гришин Е.В. Система поиска лигандов калиевого канала
человека Kv1.3. Конференция молодых ученых «Молекулярная медицина и постгеномная
биология» (Москва, 23-24 мая 2012); Эфферентная и физико-химическая медицина 2, 2012,
стр. 74.
16. Кузьменков А.И., Кудряшова К.С., Василевский А.А., Королькова Ю.В., Некрасова О.В.,
Феофанов А.В., Кирпичников М.П., Гришин Е.В. Природные яды – источник эффективных
блокаторов калиевого канала человека Kv1.3. III международная научно-практическая
конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической
медицине» (Казань, 22-24 ноября 2012); Сборник тезисов, стр. 419.
17. Кудряшова К.С., Некрасова О.В., Кузьменков А.И., Василевский А.А., Ю.В. Королькова,
Феофанов А.В., Гришин Е.В., Кирпичников М.П. Новая флуоресцентная система для поиска
блокаторов калиевых каналов Kv1.1 и Kv1.3. IV Съезд биофизиков России. Симпозиум IV
«Новые тенденции и методы в биофизике». Материалы докладов. – Нижний Новгород, 2012.
Т.4, C.53.
18. Кудряшова К.С., Кузьменков А.И., Василевский А.А., Некрасова О.В., Феофанов А.В.
Новая система поиска лигандов калиевого канала Kv1.3. Научная конференция по
3
биоорганической химии и биотехнологии “X чтения памяти академика Юрия Анатольевича
Овчинникова” 14 – 17 ноября 2011 г. Москва-Пущино, Сборник тезисов Т.1, С. 37.
19. Некрасова О.В., Кудряшова К.С., Игнатова А.А., Королькова Ю.В., Феофанов А.В.
Анализ взаимодействия лигандов с гибридным калиевым каналом KcsA-Kv1.3 в составе
мембраны бактерий. I международная научно-практическая конференция "Постгеномные
методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине", Москва, 2010 г. Тезисы
докладов, стр.180
20. Некрасова О.В., Тихонов Р.В., Тагвей А.И., Вульфсон А.Н., Якимов С.А., Корчагина
А.А. Шаронов Г.В., Феофанов А.В., Кирпичников М.П. Получение рекомбинантного
лиганда ephrin A1 в прокариотической системе экспрессии. Труды XVIII Международной
конференции и дискуссионного научного клуба «Новые информационные технологии в
медицине, биологии, фармакологии и экологии», т.2, стр. 113-115, IT+M@Ec’2010, Украина,
Крым, Ялта-Гурзуф, 31 мая-10 июня 2010 г.
21. Феофанов А.В., Некрасова О.В., Шаронов Г.В., Арсеньев А.С., Кирпичников М.П.
Клеточные системы для поиска и изучения соединений, действующих на мембранные
рецепторы: новые подходы и возможности. I международная научно-практическая
конференция "Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической
медицине", Москва, 2010 г. Тезисы докладов, стр.118
Патенты
1. Некрасова О.В., Феофанов А.В., Игнатова А.А., Назарова А.И., Королькова Ю,В.,
Болдырева Е.Ф., Чупин В.В., Гришин Е.В., Арсеньев А.С., Кирпичников М.П. Способ
качественной и количественной оценки связывания мембранного белка с лигандом. Патент
РФ № 2380421 от 27.01.2010. Бюл.3.
2. Островский М.А., Мозговая М.Н., Фельдман Т.Б., Смитиенко О.А., Шелаев И.В., Гостев
Ф.Е., Надточенко В.А., Саркисов О.М., Кирпичников М.П., Некрасова О.В. Способ
фотопереключения ретинальсодержащего белка и оптический логический элемент на его
основе. Патент РФ №2420773 от 10.06.2011 Бюл. № 16.
Участие в грантах, научных контрактах и договорах
1. Грант РФФИ "Разработка биоинженерной клеточной системы для
взаимодействия мембранных белков с лигандами" (2009-11 гг.), руководитель.
изучения
2. Грант РФФИ "Разработка способов получения новых рекомбинантных пептидных
блокаторов канала Kv1.3 и изучение свойств этих блокаторов" (2013-15 гг.), руководитель.
3. Программа Президиума РАН «Основы фундаментальных исследований нанотехнологий и
наноматериалов» по теме "Разработка технологии флуоресцентной нанодетекции лигандрецепторных взаимодействий и поиска высокоаффинных лигандов на основе белковых
наноконструкций, встроенных в липидные нанопленки" (2012-14 гг.), ответственный
исполнитель.
4
4. Программа Президиума РАН «Основы фундаментальных исследований нанотехнологий и
наноматериалов» по теме "Исследование фотохромных реакций ретиналь-содержащих
белков – зрительного и бактериального родопсинов; перспектива создания
фотопереключателей в фемто- и пикосекундной шкалах времён" (2009-11 гг.; 2012-14 гг.),
ответственный исполнитель работ по биоинженерии.
5. Программа фундаментальных исследований Президиума РАН «Наноструктуры: физика,
химия, биология, основы технологий" по теме "Ретиналь-содержащие белки – зрительный и
бактериальные
родопсины
как
прообразы
сверхбыстрых
фотодетекторов
и
фотопереключателей" (2015-17 гг.), ответственный исполнитель работ по биоинженерии.
6. Проект РНФ "Исследование молекулярных основ селективности взаимодействия
пептидных блокаторов с калиевыми каналами", (2014-16 гг.), ответственный исполнитель
работ по биоинженерии.
Сведения о личном участии в научных мероприятиях
1. I международная научно-практическая конференция "Постгеномные методы анализа в
биологии, лабораторной и клинической медицине", Москва, 2010 г., стендовый доклад.
2. XVIII Международная конференции и дискуссионный научный клуб «Новые
информационные технологии в медицине, биологии, фармакологии и экологии»,
IT+M@Ec’2010, Украина, Крым, Ялта-Гурзуф, 31 мая-10 июня 2010 г., стендовый доклад.
3. 38-ой Конгресс ФЕБО, г.Санкт-Петербург, 6-11 июля 2013 г., стендовый доклад.
4. Российский симпозиум "Белки и пептиды". г.Уфа, 11-15 июня 2013 г., стендовый доклад.
Сведения о педагогической деятельности
1. Лекция в Учебном центре ИБХ РАН "Практические аспекты гетерологической экспрессии
в E.coli" (2008-2013 гг.).
2. Руководство магистерской работой студентки Тагвей А.И., Московская Государственная
Академия тонкой химической технологии им. М.В.Ломоносова, 2010.
3. Руководство бакалаврской и магистерской работой студентки Ляпиной Е.А., МФТИ, 2013,
2015 гг.
5