Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего профессионального образования «СИБИРСКИЙ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ» Институт фундаментальной биологии и биотехнологии Кафедра биофизики РЕФЕРАТ по Информационно-коммуникационным технологиям в естественнонаучных исследованиях Современные направления исследований в области получения и практического применения аптамеров Студент БФ12-02М О.А. Зубкова Красноярск 2013 Актуальность Аптамеры представляют новое перспективное направление в медицинских исследованиях. Их применение возможно в терапии (в качестве лекарственных препаратов) и диагностики (в качестве основы для аптасенсоров) различных заболеваний, а также для целевой доставки лекарств. Актуальность Аптамеры - синтетические однонитевые молекулы РНК или ДНК, способные к специфичному связыванию с другими молекуламимишенями. Количество публикаций Результаты поиска (количество публикаций) Базы данных Ключевые слова ScienceDirect GoPubMed SpringerLink OxfordJournal aptamer 4,374 3,143 786 668 SELEX 2,097 1,006 1 034 537 aptamer + cancer 2,272 515 873 256 aptamer + glioblastoma 194 15 44 15 aptamer + bloodbrain barrier 352 4 102 12 Статистика Рисунок 1 – Количество публикаций с ключевым словом «аптамер» по данным GoPubMed Статистика Рисунок 2 – Распределение научных лабораторий, занимающихся исследованиями в области получения и практического применения аптамеров. По данным GoPubMed Статистика Страны – лидеры по количеству публикаций Россия на 16 месте с 21 публикацией Журналы с наибольшим числом публикаций Статистика Журналы с наибольшим числом публикаций Nucleic Acids Research (Oxford Journals) IF 8.026 Analytical Chemistry (ACS Publications) IF 5.856 Biosensors and Bioelectronics (Elsevier) IF 5.602 Journal of the American Chemical Society (ACS Publications) IF 9.907 Статистика Авторы наибольшего числа статей Обзор публикаций cell-SELEX технология селекции аптамеров к целым живым клеткам (Mao Ye, 2012; Nagarkatti R., 2012; Labib M.,2012) » не требуется предварительная очистка белка; » белок находится в нативной конформации и естественном молекулярном окружении; » возможность обнаружения новых, ранее неизвестных биомаркеров заболеваний. Обзор публикаций Аптамеры в терапии заболеваний (Mao Ye, 2012) онкологических » терапия эндокринной неоплазии. Аптамеры специфичные к мутантной форме RET (рецептор тирозинкиназы) ингибируют активность RETопосредованного сигнального пути; » система из двух аптамеров, связывающихся с опухолевой клеткой и NK-клеткой (nature killer cell) для повышенной цитотоксичности. Обзор публикаций Селекция аптамеров к клеткам глиобластомы (Abdullah Tahir Bayrac, 2011; Gao H., 2012) » аптамеры к клеткам глиобластомы человека линии A-172 показали специфичность к клеткам других линий этого типа опухоли ; » доставка лекарственных препаратов (в качестве модели использовали доцетаксел) к месту локализации глиомы с помощью наночастиц, покрытых аптамером. Список использованных источников: 1. Mao Ye. Generating Aptamers by Cell-SELEX for Applications in Molecular Medicine / Mao Ye, Jun Hu, Minyuan Peng, Jing Liu, Jun Liu, Huixia Liu, Xielan Zhao, Weihong Tan // International Journal of Molecular Sciences. 2012. № 13. С. 3341-3353. 2. Nagarkatti R. Development of an Aptamer-Based Concentration Method for the Detection of Trypanosoma cruzi in Blood / Nagarkatti R., Bist V., Sun S., Debrabant A. // PLOS ONE. 2012. Т 7, № 8. 12 С. 3. Labib M. Aptamer-Based Impedimetric Sensor for Bacterial Typing / Labib M., Zamay A. S., Kolovskaya O. S., Reshetneva I. T., Zamay G. S. // Analytical chemistry. 2012. № 84. С. 8114−8117. 4. Abdullah Tahir Bayrac. In Vitro Selection of DNA Aptamers to Glioblastoma Multiforme / Abdullah Tahir Bayrac, Kwame Sefah, Parag Parekh, Ceren Bayrac, Basri Gulbakan, Huseyin Avni Oktem, Weihong Tan // Chemical Neuroscience. 2011. № 2. С. 175–181. 5. Gao H. Whole-cell SELEX aptamer-functionalised poly(ethyleneglycol)-poly(ε-caprolactone) nanoparticles for enhanced targeted glioblastoma therapy / Huile Gao, Jun Qian, Zhi Yang, Zhiqing Pang, Zhangjie Xi, Shijie Cao, Yuchen Wang, Shuaiqi Pan, Shuang Zhang, Wei Wang, Xinguo Jiang, Qizhi Zhang // Biomaterials. 2012. № 33. С. 6264-6272.