Утверждаю Директор Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института биологии Уфимского научного центра РАН, д.б.н., проф. ______________Мелентьев А.И. “7” ноября 2012 г. ПРОГРАММА-МИНИМУМ кандидатского экзамена по специальности 030207 Генетика по сельскохозяйственным и ветеринарным наукам Введение В основу настоящей программы положены следующие дисциплины: общая генетика, молекулярная генетика, цитогенетика, иммуногенетика, биохимическая генетика, ветеринарная генетика. Программа разработана экспертным советом Высшей аттестационной комиссии по сельскохозяйственным наукам (зоотехническим и ветеринарным специальностям) при участии Государственного научного учреждения Всероссийского научно-исследовательского института племенного дела (ГНУ ВНИИплем). Общие сведения Истоки генетики. Понятия: ген, генотип и фенотип. Роль отечественных ученых в развитии генетики и селекции (Н.И. Вавилов, А.С. Серебровский, Н.К. Кольцов, Ю.А. Филипченко, С.С. Четвериков и др.). Значение генетики для решения задач селекции в агрономии, племенном деле и ветеринарии, биотехнологии, экологии. Наследственность и изменчивость. Виды изменчивости и их практическое значение. Импринтинг. Хромосомные основы наследственности. Гены и хромосомы. Развитие представлений о хромосомном наборе. Структура и функции хромосом. Компоненты хромосом: ДНК, РНК, белки. Взаимодействие молекул в структуре хромосом. Клеточный цикл. Митоз и мейоз. Стадии деления клетки и их генетическая сущность. Регуляция биосинтеза ДНК в митотическом цикле. Структурно-функциональная организация генома эукариот. Рекомбинация. Кроссинговер. Генетические и цитологические карты хромосом. Внеядерная наследственность. Кариотип. Современные методы анализа хромосом. Изменчивость хромосомного набора. Факторы, влияющие на хромосомный набор. Парадокс размеров генома. Роль антропогенных факторов в возникновении хромосомных аберраций. Нарушения кариотипа при инфекционных заболеваниях. Генетические факторы риска. Хромосомные мутации. Перестройки, связанные с изменением морфологии хромосом. Робертсоновские и тандемные транслокации. Перестройки, связанные с изменением числа хромосом. Спонтанная изменчивость хромосом в соматических клетках. Анеуплоидия. Полиплоидия. Механизмы фенотипического проявления хромосомного дисбаланса. Кариотип. Цитогенетические различия и видовая изоляция. Роль различных хромосомных перестроек в эволюционных преобразованиях кариотипа. Кариотипические особенности разных видов. Принцип стабильности хромосом. Молекулярные механизмы хромосомных повреждений. Репарация ДНК. Спонтанные мутации. Геномные и хромосомные мутации. Генные мутации, мутационный эффект на фенотипическом и молекулярном уровнях. Индуцированный мутагенез. Генетические эффекты радиации. Репарации повреждений генетического материала. Химический мутагенез. Действие химических мутагенов на хромосомы и ДНК. Молекулярные основы мутаций и процессов репараций. Ген, эволюция понятия гена. Структура гена и его функции. Регуляторные участки, экзоны, интроны. Взаимодействие генов: комплементарность, эпистаз, полимерия, плейотропия. Аллели. Множественный аллелизм. Рецессивные и доминантные аллели. Виды доминирования: полное, неполное, кодоминирование. Законы наследования признаков по Г. Менделю. Отклонения от законов Менделя (примеры). Моно- и полигибридное скрещивание. Понятия генотип и фенотип. Наследование качественных и количественных признаков. Локализация генов в хромосомах. Локусы. Синтения. Генетическая рекомбинация и кроссинговер. Методы картирования генов. Типы генных карт. Гомо- и гетерозиготность. Генетика пола. Половые хромосомы. Гомогаметный и гетерогаметный пол. Гермафродитизм истинный и ложный. Признаки ограниченные, контролируемые и сцепленные с полом. Особенности сцепленного с полом наследования. Генетический код и его свойства: триплетность, вырожденность, универсальность. Перекрывание и рамки считывания кодонов. Закон гомологических рядов Н.И. Вавилова. Генные комплексы. Главный комплекс гистосовместимости. Биохимический полиморфизм. Использование в селекции. Гипотезы биологической значимости белкового полиморфизма. Методы выявления биохимического полиморфизма. Полиморфные белки как маркеры хозяйственно-биологических признаков. Группы крови и их значение для селекции. Определение генотипа животного по группам крови. Методы оценки достоверности происхождения сельскохозяйственных животных по полиморфным генетическим системам. Зависимость между группами крови и продуктивными качествами у сельскохозяйственных животных. Генное сцепление и генетическое сопряжение. Тетрахорический и полихорический показатель связи. Традиционная и маркерная селекция. Изменения в генетической структуре популяций: мутации, дрейф генов, миграции, отбор. Микроэволюция. Роль микроэволюции в животноводстве. Ядерная и цитоплазматическая наследственность. Структура и функции митохондриальной ДНК. Методы анализа ДНК: секвенирование, молекулярная гибридизация, фингерпринт, рестриктный полиморфизм, ПЦР и др. Виды репарации ДНК. Значение репарации ДНК. Типы рекомбинации ДНК. Ферменты, участвующие в рекомбинации ДНК. Сайт-специфическая рекомбинация ДНК. Регуляция генной экспрессии. Введение новой генетической информации в клетки бактерий: трансформация, коньюгация, трансдукция. Эндонуклеазы рестрикции. Рестрикционный анализ ДНК. Картирование ДНК с помощью рестриктаз. Системы хозяин-вектор. Конструирование, клонирование и отбор рекомбинантных молекул ДНК. Геномные библиотеки и библиотеки кДНК. Компьютерный анализ последовательностей ДНК. Типы мобильных элементов генома. Ретротранспозоны. Прокариоты и эукариоты: особенности строения генома, репликации и транскрипции ДНК. Уникальные и повторяющиеся последовательности ДНК. Их роль и количественное соотношение в геноме. Минисателлиты. Микросателлиты. Структура ДНК и РНК. Репликация молекулы ДНК. Транскрипция и трансляция. Виды РНК. Строение рибосом и их функция. Полиморфизм последовательностей ДНК. Методы анализа и практическое использование данных. ДНК-диагностика наследственных заболеваний сельскохозяйственных животных. Методы трансгенеза сельскохозяйственных животных. Практическое значение. Клонирование животных. Практическое значение. Получение химерных животных. Практическое значение. Генетические основы устойчивости к инфекционным и неинфекционным заболеваниям. Гены-кандидаты восприимчивости сельскохозяйственных животных к заболеваниям. Гены-кандидаты, ответственные за хозяйственно–полезные признаки сельскохозяйственных животных. Литература Дубинин Н.П. Общая генетика. М.: Наука, 1986 г. Сингер М., Берг П. Гены и геномы. М.: Мир, 1998 г. Айала Ф., Кайгер Дж. Современная генетика: В 3-х т. М.: Мир, 1987 г. Лобашев М.Е. Генетика. Л.: Изд-во Ленинградского ун-та, 1969 г. Алиханян С.И., Акифьев А.П., Чернин Л.С. Общая генетика. М.: Высшая школа, 1985 г. Босток К., Самнер Э. Хромосома эукариотической клетки. М.: Мир, 1981 г. Смирнов В.Г. Цитогенетика. М.: Высшая школа, 1991 г. Стент Г., Кэлиджер Р. Молекулярная генетика. М.: Мир, 1986 г. Дополнительная литература Глазко В.И., Дунин И.М., Глазко Г.В., Калашникова Л.А. Введение в ДНК-технологии. М.: Агротехинформ, 2001 г. Яковлев А.Ф. Цитогенетическая оценка племенных животных. М.: Агропромиздат, 1985 г. Кленовицкий П.М., Моисейкина Л.Г., Марзанов Н.С. Цитогенетика сельскохозяйственных животных. Элиста: 1999 г. Орлов В.Н., Булатова Н.Ш. Сравнительная цитогенетика и кариосистематика млекопитающих. М.: Наука, 1983 г. Дыбан А.П., Баранов В.С. Цитогенетика развития млекопитающих. М.: Наука, 1981 г. ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ПРОГРАММА Молекулярно-генетические системы управления. Элементарные генетические структуры и события. Память. Информация. Процессы кодирования, хранения, переработки и передачи генетической информации. Элементы неканонической теории наследственности. Структурная и функциональная информация. Функциональная наследственная память. Эпигены. Эпигенотип. Генные сети: структура, динамика, функции. Генные сети, управляющие онтогенетическими процессами: система управления развитием ?фага, система управления ранним онтогенезом Drosophila melanogaster, система управления морфогенезом цветка Arabidopsis thaliana. Изменение структуры бактериальных геномов в процессе функционирования и эволюции. Параметрическая устойчивость генных сетей про- и эукариот. Использование генной инженерии для создания искусственных генетических сетей. Прокариотические системы хозяин-вектор. Конструирование экспрессирующих векторов. Математические методы исследования управляющих генных сетей про- и эукариот. Метод обобщенных пороговых моделей для анализа динамики молекулярно-генетических систем управления. ЛИТЕРАТУРА Жимулев И.Ф. Общая и молекулярная генетика. Новосибирск: Сибирское университетское издательство, 2003. Колчанов Н.А., Суслов В.В., Гунбин К.В. Моделирование биологической эволюции: регуляторные генетические системы и кодирование сложности биологической организации // Вестник ВОГиС. – 2004. – Т. 8. – № 2. – С. 86-99. Патрушев Л.И. Искусственные генетические системы. – М.: Наука, 2004. Пташне М. Переключение генов. Регуляция генной активности и фаг лямбда: Пер. с англ. – М.: Мир, 1989. – 160 с. Ратнер В.А. Молекулярно-генетические системы управления. – Новосибирск: Наука, Сибирское отделение, 1975. – 286 с. Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А. и др. Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития // Вестник ВОГиС. – 2005. – Т. 9. – С. 232-261. Сингер М., Берг П. Гены и геномы. – М.: Мир, 1998. – Т. 2. – 391 с. Чураев Р.Н. Контуры неканонической теории наследственности: от генов к эпигенам // Журнал общей биологии. – 2005. – Т. 66. – № 2. – С. 99-122. Coen E.S., Meyerowitz E.M. (1991). The war of the whorls: genetic interactions controlling flower development // Nature. – V. 353. – P. 31-37. Driever, W. and Nusslein-Volhard, C. (1988). A gradient of bicoid protein in Drosophila embryos // Cell. – V. 54. – P. 83-93. Tchuraev R. N. (1991). A New Method for the Analysis of the Dynamics of the Molecular Genetic Control Systems. I. Description of the Method of Generalized Threshold Models // J. theor. Biol. – V. 151. – P. 71-87. Программы рассмотрены и утверждены на заседании Ученого совета Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института биологии Уфимского научного центра РАН, протокол № 9 от 7 ноября 2012 г.