Соискатель гранта на право получения гранта Президента

Соискатель гранта на право получения гранта Президента Российской Федерации
для государственной поддержки молодых российских ученых - кандидатов наук
(конкурс МК-2014) - Буланенкова Светлана Сергеевна
Сведения о научной работе.
Буланенкова Светлана Сергеевна, кандидат биологических наук (защита состоялась в
2008 г. в ИБХ РАН), должность – научный сотрудник Лаборатории структуры и функций
генов человека.
Название представляемой работы: Определение степени открытости хроматина на
уровне полного генома человека.
Аннотация:
Геномная ДНК эукариотических клеток со связанными с ней ядерными
белками образует хроматин. В зависимости от доступности ДНК для
ДНК-связывающих факторов условно выделяют участки открытого,
транскрипционно активного и «молчащего» закрытого хроматина. Любые
изменения в структуре хроматина влияют на экспрессию соответствующих
генов. Очевидно, что исследование структуры хроматина является
актуальной проблемой современной молекулярной биологии.
В рамках проекта предполагается разработать in vivo метод полногеномной
идентификации участков «открытого» хроматина с целью построения карты
их распределения в геноме человека и ее последующего анализа.
Выполнение проекта позволит получить приоритетные данные об
эпигенетическом состоянии хроматина и расположении потенциальных
регуляторных элементов в геноме человека.
Публикации в рецензируемых журналах:
1. Акопов С.Б., Чернов И.П., Ветчинова А.С., Буланенкова С.С., Николаев Л.Г.
Идентификация и картирование цис-регуляторных элементов внутри длинных
геномных последовательностей. Молекулярная биология (2007), 41(5): 787-792.
2. Акопов С.Б., Чернов И.П., Буланенкова С.С., Скворцова Ю.В., Ветчинова А.С.,
Николаев Л.Г. Методы идентификации эпигенетических элементов
млекопитающих в длинных мультигенных геномных последовательностях.
Биохимия (2007), 72(6): 725-732
3. S Bulanenkova, E Snezhkov, L Nikolaev, and E Sverdlov. Identification and mapping of
open chromatin regions within a 140 kb polygenic locus of human chromosome 19 using
E. coli Dam methylase. Genetica (2007), 130(1): 83-92.
4. SS Bulanenkova, AA Kozlova, ES Kotova, EV Snezhkov, TL Azhikina, SB Akopov, LG
Nikolaev, and ED Sverdlov. Dam methylase accessibility as an instrument for analysis of
mammalian chromatin structure. Epigenetics (2011), 6(9): 1078-84.
5. Михайлов В.С., Потапов В.К., Амирханов Р.Н., Амирханов Н.В., Буланенкова С.С.,
Акопов С.Б., Зарытова В.Ф., Николаев Л.Г., Свердлов Е.Д. Аффинный захват
заданных фрагментов ДНК с помощью коротких синтетических
последовательностей. Биоорганич. Химия, 2013, т. 39, №1, стр. 81-86
Публикации в материалах научных мероприятий:
1. Буланенкова С.С., Снежков Е.В., Николаев Л.Г., Свердлов Е.Д. Использование
метилазы Dam E. coli для анализа структуры хроматина млекопитающих.
Материалы конференции “Генетика в России и мире”, Москва, июль 2006, стр. 24.
2. Е.С. Котова, С.С. Буланенкова, Е.В. Снежков, Л.Г. Николаев, Е.Д. Свердлов.
Использование метилазы Dam E.coli для анализа структуры хроматина
млекопитающих. XIX Зимняя молодежная научная школа «Перспективные
направления физико-химической биологии и биотехнологии, Москва, 7-9 февраля
2007 г; тезисы докладов и стендовых сообщений, стр 38.
3. С.С. Буланенкова, Е.В. Снежков, Л.Г. Николаев, Е.Д. Свердлов. Использование
метилазы Dam E.coli для анализа структуры хроматина млекопитающих.
Цитология 2005, 47: 797.
4. Буланенкова С.С., Котова Е.С., Снежков Е.В., Николаев Л.Г., Свердлов Е.Д.
Использование метилазы Dam E. coli для анализа структуры хроматина
млекопитающих. Международная молодежная научно-методическая конференция
«Проблемы молекулярной и клеточной биологии», 9-12 мая 2007, Томск; сборник
материалов, стр. 33.
5. S.S. Bulanenkova, E.S. Kotova, E.V. Snezhkov, L.G. Nikolaev, E.D. Sverdlov.
Identification and mapping of open chromatin regions within extended genome regions
using E. coli Dam methylase. Сonference for young scientists, PhD students and students
on molecular biology and genetics dedicated to 120th anniversary of M.I. Vavilov, Kyiv,
Ukraine, 20-22 September 2007. Abstract book, p. 52.
6. Буланенкова С.С., Котова Е.С., Снежков Е.В., Николаев Л.Г., Свердлов Е.Д.
Использование метилазы Dam E. coli для анализа структуры хроматина
млекопитающих.
XX
зимняя
международная
молодежная
научная
школа
“Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”,
Москва, 11-15 февраля 2008г.; сборник материалов и тезисов, стр. 34.
7. Буланенкова С.С., Котова Е.С., Снежков Е.В., Акопов С.Б., Николаев Л.Г.,
Свердлов Е.Д. Бактериальная метилаза DAM как метод исследования структуры
хроматина млекопитающих. Научная конференция по биоорганической химии и
биотехнологии. Х чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова.
Москва-Пущино, 14-17 ноября 2011 г. Сборник материалов и тезисов, стр. 13.
8. Михайлов В.С., Буланенкова С.С., Потапов В.К., Николаев Л.Г., Свердлов Е.Д.
Специфический отбор фрагментов ДНК с помощью олигонуклеотидов с
повышенным сродством к матрице. Сборник тезисов VIII Международной
конференции «Молекулярная генетика соматических клеток», 6-9 декабря 2011 г.,
Звенигород, Москва, стр. 41.
9. S. Bulanenkova, E. Kotova, E. Snezhkov, S. Akopov. Dam methylase accessibibility as
an instrument for analysis of mammalian chromatin structure. 37 FEBS congress, The
FEBS Journal (2012), 279 (Suppl.), p. 493.
10. Михайлов В.С., Буланенкова С.С., Потапов В.К., Николаев Л.Г., Свердлов Е.Д.
Специфический отбор фрагментов ДНК с помощью олигонуклеотидов с
повышенным сродством к матрице. Сборник тезисов XXIV Зимней молодежной
научной школы «Перспективные направления физико-химической биологии и
биотехнологии», Москва, 7-9 февраля 2012 г, стр. 50.
11. Буланенкова С.С. In vivo анализ структуры хроматина человека. XXV
Международная зимняя молодежная научная школа “Перспективные направления
физико-химической биологии и биотехнологии”, посвященная 30-летию научнообразовательного центра ИБХ РАН, Москва 11-15 февраля 2013г. Том. 1, Тез.
Докл. Стр. 29.
Список грантов:
Грант РФФИ 12-04-32163-мол_а (руководитель); Грант Президента Российской
Федерации "Ведущие научные школы" НШ-1674.2012.4 (исполнитель); Программа
Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология» (исполнитель)
Сведения о педагогической деятельности:
Осуществляла руководство студентами при подготовке 2 курсовых и 1 дипломной
работы.
Сведения о премиях и наградах за научную и педагогическую деятельность: нет