МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Дальневосточный федеральный университет» (ДВФУ) ПРОГРАММА КАНДИДАТСКОГО ЭКЗАМЕНА по образовательной программе высшего образования – программе подготовки научнопедагогических кадров в аспирантуре Биохимия Направление – 06.06.01. Биологические науки Профиль – 03.01.04. Биохимия Форма подготовки (очная) Школа естественных наук ДВФУ Кафедра биохимии, микробиологии, биотехнологии Программа кандидатского экзамена составлена в соответствии с требованиями федерального государственного образовательного стандарта высшего образования (уровень подготовки кадров высшей квалификации), утвержденного приказом министерства образования и науки РФ от 30.07.2014 г. № 871 Программа кандидатского экзамена обсуждена на заседании кафедры биохимии, микробиологии, биотехнологии ШЕН ДВФУ, протокол № 7 от «11» февраля 2015 г. Заведующий кафедрой: Э.Я.Костецкий Составители: д-р биол. наук, профессор Э.Я.Костецкий, д-р биол. наук, профессор, профессор каф. биохимии, микробиологии, биотехнологии Н.М.Санина, канд. биол. наук, доцент, доцент каф. биохимии, микробиологии, биотехнологии А.В.Цыбульский. I. Программа кандидатского экзамена пересмотрена на заседании кафедры: Протокол от «_____» _________________ 20__ г. № ______ Заведующий кафедрой _______________________ __________________ (подпись) (И.О. Фамилия) II. Программа кандидатского экзамена пересмотрена на заседании кафедры: Протокол от «_____» _________________ 20__ г. № ______ Заведующий кафедрой _______________________ __________________ (подпись) (И.О. Фамилия) 2 АННОТАЦИЯ Программа кандидатского экзамена по специальной дисциплине «Биохимия» предназначена для обучающихся по образовательной программе высшего образования - программе подготовки научно-педагогических кадров в аспирантуре по направлению (06.06.01. Биологические науки), профилю (03.01.04. Биохимия). Программа федеральных кандидатского государственных профессиональной экзамена требований образовательной составлена к на основании структуре программы основной послевузовского профессионального образования (аспирантура), утвержденных приказом Министерства образования и науки от 16 марта 2011 № 1365, Типовой программы кандидатского экзамена по специальности, утвержденной приказом Минобрнауки России от 8 октября 2007 г. № 274 (программы доступны на сайте ВАК http://vak.ed.gov.ru/ru/help_desk) и учебного плана программы послевузовского профессионального образования по специальности 03.01.04 – Биохимия в федеральном государственном автономном образовательном учреждении высшего профессионального образования «Дальневосточный федеральный университет». Кандидатский экзамен проводится в форме устного экзамена. Программа кандидатского экзамена включает в себя: • аннотацию; • содержание кандидатского экзамена; • вопросы к экзамену; • список рекомендуемой литературы и источников. 3 СОДЕРЖАНИЕ КАНДИДАТСКОГО ЭКЗАМЕНА I. Модуль 1. Общая биохимия. Раздел 1. Предмет, роль и задачи биохимии в системе естественных наук 1.1. Биохимия - ее задачи и место среди других наук. Место биохимии в системе дисциплин, связанных с физико-химической биологией, молекулярной биологией и биотехнологией. 1.2. Практическое приложения достижений биохимии. Биохимия как фундаментальная основа молекулярной биотехнологии, генной инженерии, фармакологии, практической медицины. Направления и перспективы развития биохимии в области ферментологии, липидологии, протеомики. 1.3. Методы и методология изучения биохимии. Методики – технологические приемы исследования организмов, органов, тканей, клеточных и внутриклеточных структур, надмолекулярных и молекулярных структур. Методологические подходы к исследованию. Хроматографические методы, колоночная хроматография, спектроскопия, хроматомасспектрометрия. Электронная микроскопия и др.. Метод как методология - общий подход, принцип, логика исследования. Раздел 2. Физико-химические основы биохимии. 2.1. Физико-химические характеристики воды как универсального растворителя в биологических системах. Основные понятия электрохимии водных растворов. Закон действующих масс, константы диссоциации кислот и оснований, водородный показатель (рН), буферные растворы. 2.2. Основные физико-химические методы применяемые в биохимии: хроматография (ТСХ, ГЖХ, колоночная, препаративная ТСХ и т.д.), спектрофотометрия, флуорометрия, ЭПР и ЯМР – спектроскопия, калориметрия, микрокалориметрия, электрофорез, вискозиметрия, рентгеноструктурный анализ, хромато-масс спектрометрия, ГЖХ, ВЭЖХ. 2.3. Структура и физико-химические свойства низкомолекулярных соединений, входящих в состав биологических объектов: аминокислоты, углеводы, липиды, нуклеиновые кислоты. 4 Раздел 3. Природные аминокислоты. 3.1. Различные способы классификации аминокислот. Общие и специфические реакции функциональных групп аминокислот. Ионизация аминокислот. Методы разделения и идентификации аминокислот и пептидов. Раздел 4. Природные углеводы. 4.1. Природные углеводы и их производные. Стереохимия углеводов. Гликозиды, амино-, фосфо- и сульфосахариды. Дезоксисахара. Методы разделения и идентифи Раздел 5. Липофильные соединения. 5.1. Неполярные липиды. Насыщенные и ненасыщенные жирные кислоты, альдегиды, спирты. Изомерия и структура ненасыщенных жирных кислот. Оксилипины – универсальные гормоны. Нейтральные липиды. Стерины, воска. 5.2. Полярные липиды. Фосфолипиды. Гликолипиды: цереброзиды, олигоцереброзиды, ганглиозиды – структура, свойства. Методы разделения и идентификации липофильных соединений. Раздел 6. Структурные компоненты нуклеиновых кислот. 6.1. Пуриновые и пиримидиновые основания. Нуклеозиды и нуклеотиды. Циклические нуклеотиды. Минорные пуриновые и пиримидиновые основания. Комплексообразующие свойства нуклеотидов. Нуклеопротеиды. Роль нуклеиновых кислот и их компонентов. Раздел 7. Витамины и другие биологически активные соединения. 7.1. Витамины как кофакторы ферментов. Амид никотиновой кислоты и его производные. Биотин. Тиамин. Рибофлавин и его производные. Пантотеновая кислота. Пиридоксин и пиридоксаль. Кобаломин. Аскорбиновая кислота. Ретиноиды. Витамин Д, стероиды. Токоферол. Нафтахинон и убихинон. 7.2. Биологически активные соединения. 5 Оксилипины (Простагландины, тромбоксаны, простациклины, лейкотриены, липоксины), как универсальные гормоны. Биогенне амины. Ацетилхолин. Железопорфирины. Хлорофил и другие растительные пигменты. Минеральный состав клеток. Микроэлементы. Модуль 2. Структура и свойства биополимеров. Раздел 1. Роль физико-химических связей в организации белковых структур. 1.1. Пептидная связь и структура полипептидов. Уровни структурной организации белков. Упорядоченные (α- спираль, β - слои) и неупорядоченные структуры полипептидной цепи. Природа химических связей, обеспечивающих структуры белка. Денатурация белков и полипептидов. Амфипатия полипептидных цепей. Динамичность структуры белка. Методы определения первичной структуры белка. 1.2.Свойства белковых биополимеров. Липопротеины, гликопротеиды, фосфопротеиды. Комплексы белков с низкомолекулярными соединениями. Сольватация белков. Кристаллические белки. Методы определения пространственного расположения полипептидных цепей. Олигомерные комплексы белков. Гомологичные последовательности аминокислот в полипетидах. Предсказание структуры белка на основании первичных последовательностей аминокислот. Специфические приемы очистки белков (хроматография, электрофорез, иммунопреципитация, ультрафильтрация, избирательное осаждение, денатурация). Реакционная способность аминокислотных остатков в молекулах нативных и денатурированных белков. Взаимодейсствие белков и малых лигандов. Структура гемоглобина. Миоглобина и связывание ими кислорода. Раздел 2.Структура и свойства углеводных полимеров. 2.1. Олиго и полисахариды. Структура крахмала, гликогена, целлюлозы, гетерополисахаридов (гепарин, глюкуроновая, галактуроновая и др.). Протеогликаны. Методы изучения первичной, вторичной и более высоких уровней структурной организации полисахаридов, гликопротенинов и протеогликанов. 6 Раздел 3. Амфифильные соединения. 3.1. Поолиморфизм амфифильных соединений в водных растворах (мицеллы, эмульсии, ламеллы, бислойные структуры). 3.2. Модели строения биологических мембран. Липосомы, методы их получения и изучения. Фазовые переходы в агрегатах амфифильных соединений. Проницаемость биологических мембран. Электрохимия осмотических явлений. Методы изучения биологических мембран ( репортёрные метки, микрокалориметрия, светорассеивание). Раздел 4. Структура и свойства нуклеиновых кислот. 4.1. Структура ДНК. А, В, С и Z- формы ДНК, их структурные особенности и нахождение в клетках. Структурная организация хроматина, ядерного матрикса и структуры ядерных мембран.. Суперспирализация ДНК. Структуры РНК – матричной, рибосомальной, транспортной, информосомной. ядерной. Взаимодействие белков и нуклеиновых кислот. Методы изучения структуры нуклеиновых кислот. Модуль 3. Обмен веществ в живых клетках. Раздел 1.Круговорот веществ в биосфере. 1.1. Биологические объекты как стационарные системы. Сопряжение биохимических реакций. Метаболические цепи, сети и циклы. Обратимость биохимических процессов. Катаболические и анаболические процессы. Единство основных метаболических путей во всех живых системах. 1.2.Ферментативный катализ. Белки-ферменты. Основные понятия ферментативной кинетики. Ферментсубстратные комплексы. Уравнение Михаэлиса-Бригса-Холдейна. Константа Михаэлиса. Активность и число оборотов ферментов. Динамичность структуры белка и ферментативный катализ. Химические механизмы ферментативного катализа (сериновые протеазы, пиридоксалевый катализ, карбоангидраза и др). 1.3. Специфика ферментов. Классификация ферментов. Ингибиторы и активаторы ферментов. Кофакторы в ферментативном катализе. Изостерические и аллостерические лиганды регуляторы. Кооперативность в ферментативном катализе. Фермент как молекулярная машина. 7 Модели кооперативного функционирования ферментов(модель Моно- ВайманаШанжё, модель Немети-Кошланда). Локализация ферментов в клетке. Раздел 2. Основные понятия в биоэнергетике. 2.1. АТФ – универсальный источник энергии в биологических системах. Соединения с высоким потненциалом переноса групп (нуклеозидтрифосфаты, пирофосфат, гуанидинфосфаты, ацилтиоэфиры). Энергетическое сопряжение. Фосфорильнфый потенциал клетки. Нуклеозид ди- и три- фосфаткиназы. Аденилаткиназная и креатинкиназная реакции. Раздел 3. Биохимия пищеварения. 3.1. Биохимия пищеварения белков, углеводов, липидов. Органная специфичность пищеварительных протеаз. Органная специфичность пищеварительных липаз и гликозидаз. Роль желчных кислот в превращении липидов и транспорте метаболитов через биологические мембраны. Понятие об активном транспорте, секреции, пиноцетозе. Раздел 4. Гликолиз, декарбоксилирование пировиноградной кислоты, цикл Кребса и гликонеогенез, как метаболическая система. 4.1. Структура и механизм действия отдельных ферментов гликолиза гликонеогенеза. Механизм декарбоксилирования пировиноградной и кислоты. Энергетическая эффективность гликолиза и декарбоксилирования пировиноградной кислоты.. 4.2. Цикл Кребса. Энергетика брожения и дыхания. Общая схема процесса дыхания. Структура и механизм действия отдельных ферментов цикла ди- и три- карбоновых кислот. Значение цикла Кребса в клеточной энергетике и синтезе аминокислот. Переаминирование и другие пути превращения аминокитслот. Заменимые и незаменимые аминокислоты. Пищевая ценность белков. 4.3. Синтез органических соединений. Синтез полисахаридов. Пути включения углерода, азота, серы и др. неорганических соединений в органические. Синтез жирных кислот. Синтез 8 пуриновых и пиримидиновых оснований. Синтез фосфолипидов и нейтрального жира. Образование биологических мембран. Биосинтез аминокислот. 4.4. Цикл мочеобразования. Уреотелия, урикотелия и аммониотелия. Структура и механизм действия трансаминаз и отдельных ферментов цикла мочевинообразования. Специфическая деструкция отдельных аминокислот. 4.5. Липолиз. Роль желчных кислот в метаболизме липофильных соединений. Окислительный распад жирных кислот. Энергетическая эффективность окисления жирных кислот. Роль карнитина в метаболических проевращениях жирных кислот. 4.6. Распад нуклеиновых кислот. Ферменты синтеза и распада нуклеиновых кислот. Нуклеазы. Деструкция пуриновых и пиримидиновых оснований. Модуль 4. Энергия в живых клетках. Раздел 1. Свет – источник жизни на Земле. 1.1. Растительные пигменты. Фотосинтез. Структура фотосинтетического аппарата. Хлорофил и фотосинтетические антены. Структура фотосинтетических реакционных центров. Световые и темновые стадии фотосинтеза. Фотосистемы I и II. Реакция Хилла. Ферредоксины. Цикл Кальвина. Раздел 2. Терминальное окисление. 2.1. Механизмы активации кислорода. Оксидазы. (NAD+//NAD.H. Коферменты NADP+/NADP.H,. окислительно-востановительных реакций FAD/FAD.H2). Электрон FMN/FMN/H2. трансферазные реакции. Убихинон., железо-серные белки и цитохромы как компоненты дыхательной цепи. Локализация электрон-трансфераз в биологических мембранах. Циклический векторный перенос протона. Биологические генераторы разности электрохимических потенциалов ионов. Электрохимическое сопряжение в мембранах и механизмы окислительного и фотофосфорелирования. Разообщители и ионофоры. Общность мембранных преобразователей энергии митохондрий, 9 хлоропластов и хроматофоров. Эффективность аккумуляции энергии, сопряженной с переносом электронов. Альтернатиывные функции биологического окисления. Термогенез. Дыхательная цепь микросом. Цитохром Р-450 и окислительная деструкция ксенобиотиков. 2.2. Поддержание ионного гомеостаза клеток. Транспортные АТФазы. Биохимические основы передачи нервногоимпульса. Ионные потоки при возбуждении нерва. Синаптическая передача возбуждения. Ацетилхолин, ацетилхолинэстераза, рецепция ацетилхолина. Модуль 5. Хранение и реализация генетической информации. Раздел 1. Основные участники хранения и реализации генетической информации. 1.1. Понятие ген, оперон. Клеточный цикл. Активный и неактивный хроматин. Структура хромосом. Синтез ДНК и ДНК полимеразы. Репликация ДНК. Циклическая ДНК и технология включения генов в плазмиды. Мутации и направленный мутагенез. 1.2. Транскрипция. Процесс транскрипции. РНК-полимераза и образование матричной РНК. Посттранскрипционный процессинг м-РНК. 1.3. Трасляция и синтез белка. Биосинтез белка. Генетический код. М-РНК,т-РНК, р-РНК и общая схема трансляции. Структура рибосом. Инициация трансляции, элонгации и терминации. Посттрансляционная модификация белков. Транспорт белков и проницаемость биологических мембран для биополимеров. Модуль 6. Интеграция и регулирование метаболизма. Раздел 1. Связь метаболических путей превращения белков, жиров, углеводов и других соединений. 1.1. Ключевые ферменты. Способы регулирования метаболизма. Регулирование экспрессии генов. Наследственные болезни. Посттрасляционная ковалентная модификация белков (внутриклеточные протеазы и протеинфосфатазы, 10 метилирование и др. модификации). Регулирование активности ферментов субстратом, продуктом и метаболитами. Молекулярные основы гомеостаза клетки. 1.2. Кровь, плазма, лимфа. Транспорт кислорода эритроцитами. Буферные системы крови. Системы свёртывания крови. Белки плазмы крови и функциональная биохимия форменных элементов крови. Биохимические основы иммунитета. 1.3. Гормоны. Способы классификации гормонов. Рецепторы гормонов. Тканевая и видовая специфичность рецепторов гормонов. Понятие о вторичных мессенджерах. Аденилатциклаза и фосфодиэстераза. Ц-АМФ, как вторичный мессенджер и посттрансляционная модификация белков-ферментов. Ионы Ca2+ и фосфатидилинозитиды в качестве вторичных мессенджеров. Рецепция света живыми системами. ВОПРОСЫ КАНДИДАТСКОГО ЭКЗАМЕНА 1. Амид никотиновой кислоты и его производные. Биотин. Тиамин. 2. АТФ – универсальный источник энергии в биологических системах. Соединения с высоким потенциалом переноса групп (нуклеозидтрифосфаты, пирофосфат, гуанидинфосфаты, ацилтиоэфиры). 3. Биологические генераторы разности электрохимических потенциалов ионов. Электрохимическое сопряжение в мембранах и механизмы окислительного и фотофосфорелирования. Разообщители и ионофоры. Общность мембранных преобразователей энергии митохондрий, хлоропластов и хроматофоров. Эффективность аккумуляции энергии, сопряженной с переносом электронов. Альтернатиывные функции биологического окисления. Термогенез. Дыхательная цепь микросом. Цитохром Р-450 и окислительная деструкция ксенобиотиков. 4. Биосинтез белка. Генетический код. М-РНК,т-РНК, р-РНК и общая схема транскрипции. Структура рибосом. Инициация трансляции., элонгации и терминации. Посттрансляционная модификация белков. Транспорт белков и проницаемость биологических мембран для биополимеров. 11 5. Биохимия пищеварения. Органная специфичность пищеварительных протеаз. Липаз и гликозидаз. Транспорт метаболитов через биологические мембраны. Понятие об активном транспорте, секреции, пиноцетозе. 6. Витамины, коферменты и другие биологически активные соединения. 7. Гликолиз и гликонеогенез как метаболическая система. Структура и механизм действия отдельных ферментов гликолиза и гликонеогененза. Энергетическая эффективность гликолиза. Структура и механизм действия отдельных ферментов цикла ди- и три- карбоновых кислот. 8. Гликонеогенез, Синтез полисахаридов. Пути включения углерода, азота, серы и др. неорганических соединений в органические. Синтез жирных кислот. Синтез пуриновых и пиримидиновых оснований. Синтез фосфолипидов и нейтрального жира. Образование биологических мембран. Биосинтез аминокислот. 9. Гормоны. Способы классификации гормонов. Рецепторы гормонов. 10. Динамичность Химические механизмы структуры белка ферментативного и ферментативный катализа (сериновые катализ. протеазы, пиридоксалевый катализ, карбоангидраза и др). 11. Динамичность структуры белка. Методы определения первичной структуры белка. Липопротеины, гликопротеиды. 12. Интеграция и регулирование метаболизма. 13. Классификация ферментов. Ингибиторы и активаторы ферментов. Кофакторы в ферментативном катализе. Изостерические и аллостерические лиганды регуляторы. 14. Комплексы белков с низкомолекулярными соединениями. Сольватация белков. 15. Кооперативность в ферментативном катализе. Фермент как молекулярная машина. Модели кооперативного функционирования ферментов (модель Моно-ВайманаШанжё, модель Немети-Кошланда). Локализация ферментов в клетке. 16. Кристаллические белки. 12 17. Кровь, плазма, лимфа. Транспорт кислорода эритроцитами. Буферные системы крови. Системы свёртывания крови. Белки плазмы крови и функциональная биохимия форменных элементов крови. Биохимические основы иммунитета. 18. Круговорот веществ в биосфере. Биологические объекты как стационарные системы. 19. Липолиз. Роль желчных кислот в метаболизме липофильных соединений. Окислительный распад жирных кислот. Энергетическая эффективность окисления жирных кислот. Роль карнитина в метаболических превращениях жирных кислот. 20. Липофильные соединения. Насыщенные и ненасыщенные жирные кислоты. Изомерия и структура ненасыщенных жирных кислот. Нейтральные жиры. Фосфолипиды. Стерины, холестерин и желчные кислоты. Методы разделения и идентификации липофильных соединений. 21. Место биохимии в системе дисциплин, связанных с физико- химической биологией, молекулярной биологией и биотехнологией. 22. Методы изучения первичной, вторичной и более высоких уровней структурной организации полисахаридов, гликопротенинов и протеогликанов. 23. Методы определения пространственного расположения полипептидных цепей. Олигомерные комплексы белков. Гомологичные последовательности аминокислот в полипетидах. Предсказание структуры белка на основании первичных последовательностей аминокислот. 24. Методы разделения и идентификации аминокислот и пептидов. Природные углеводы и их производные. Стереохимия углеводов. Гликозиды, амино-, фосфо- и сульфосахориды. Дезоксисахара. Методы разделения и идентификации углеводов. 25. Минеральный состав клеток. Микроэлементы. Методы аналитической бионеорганической химии. 26. Модели строения биологических мембран. Липосомы, методы их получения и изучения. Фазовые переходы в агрегатах амфифильных соединений. Проницаемость биологических мембран. 13 27. Молекулярные основы подвижности биологических систем. Структура поперечно-полосатой и гладкой мускулатуры. Сократительные белки. Модели функционирования мышц. Подвижность жгутиков и ресничек микроорганизмов. 28. Олиго и полисахариды. Структура крахмала, гликогена, целлюлозы. Протеогликаны. 29. Основные понятия ферментативной кинетики. Фермент-субстратные комплексы. Уравнение Михаэлиса-Бригса-Холдейна. Константа Михаэлиса. Активность и число оборотов ферментов. 30. Основные физико-химические методы, применяемые в биохимии: хроматография (ТСХ, ГЖХ, колоночная, препаративная ТСХ и т.д.), спектрофотометрия, флуорометрия, 31. Пептидная связь и структура полипептидов. Уровни структурной организации белков. Упорядоченные (α- спираль, β- слои) и неупорядоченные структуры полипептидной цепи. Природа химических связей, обеспечивающих структуру белка. Денатурация белков и полдипептидов. Амфипатия полипептидных цепей. 32. Переаминирование и другие пути превращения аминокитслот. Заменимые и незаменимые аминокислоты. Пищевая ценность белков. Цикл мочеобразования. Уреотелия, урикотелия и аммониотелия. 33. Поддержание ионного гомеостаза клеток. Транспортные АТФазы. Биохимические основы передачи нервногоимпульса. Ионные потоки при возбуждении нерва. Синаптическая передача возбуждения. Ацетилхолин, ацетилхолинэстераза, рецепция ацетилхолина. 34. Понятие ген, оперон. Клеточный цикл. Активный и неактивный хроматин. Структура хромосом. Синтез ДНК и ДНК полимеразы. Репликация ДНК. Циклическая ДНК и технология включения генов в плазмиды. Мутации и направленный мутагенез. 35. Поолиморфизм амфифильных соединений в водных растворах (мицеллы, эмульсии, ламеллы, бислойные структуры). 14 36. Практические приложения достижений биохимии; биохимия как фундаментальная основа молекулярной биотехнологии. Направления и перспективы развития биохимии. 37. Природные аминокислот. Общие аминокислоты. Различные способы и специфические реакции классификации функциональных групп аминокислот. Ионизация аминокислот. 38. Процесс транскрипции. РНК-полимераза и образование матричной РНК. Посттранскрипционный процессинг м-РНК. 39. Пуриновые и пиримидиновые основания. Нуклеозиды и нуклеотиды. Циклические нуклеотиды. Минорные пуриновые и пиримидиновые основания. Комплексообразующие свойства нуклеотидов. 40. Распад нукленовых кислот. Нуклеазы. Деструкция пуриновых и пиримидиновых оснований. 41. Реакционная способность аминокислотных остатков в молекулах нативных и денатурированных белков. Взаимодейсствие белков и малых лигандов. Структура гемоглобина. Миоглобина и связывание ими кислорода. 42. Регулирование активности ферментов субстратом, продуктом и метаболитами. Молекулярные основы гомеостаза клетки. 43. Рибофлавин и его производные. Пантотеновая кислота. Пиридоксин и пиридоксаль. Кобаломин. Аскорбиновая кислота. Ретиноиды. Витамин Д, стероиды. Токоферол. Нафтахинон и убихинон. Простагландины. Биогенные амины. Ацетилхолин. Железопорфирины. Хлорофил и другие растительные пигменты. 44. Связь метаболических путей превращения белков, жиров, углеводов и других соединений. 45. Сопряжение биохимических реакций. Метаболические цепи, сети и циклы. Обратимость фотохимических процессов. Катаболические и анаболические процессы. Единство основных метаболических путей во всех живых системах. 46. Специфические приемы очистки белков (хроматография, электрофорез, иммунопреципитация, ультрафильтрация, избирательное осаждение, денатурация). 15 47. Структура ДНК. В и Z- формы ДНК. Структурная организация хроматина. Суперспирализация ДНК. Структуры РНК. Взаимодействие белков и нуклеиновых кислот Методы изучения структуры нуклеиновых кислот. 48. Структура и механизм действия трансаминаз и отдельных ферментов цикла мочевинообразования. Специфическая деструкция отдельных аминокислот. Структура 49. и физико-химические свойства низкомолекулярных соединений, входящих в состав биологических объектов. 50. Терминальное окисление. Механизмы активации кислорода. Оксидазы. Коферменты окислительно-восстановительных реакций (NAD+//NAD.H. NADP+/NADP.H,. FMN/FMN/H2 FAD/FAD.H2). Электрон трансферазные реакции. Убихинон., железо-серные белки и цитохромы как компоненты дыхательной цепи. Локализация электрон-трансфераз в биологических мембранах. Циклический векторный перенос протона 51. Тканевая и видовая специфичность рецепторов гормонов. Понятие о вторичных мессенджерах. Аденилатциклаза и фосфодиэстераза. Ц-АМФ, как вторичный мессенджер и посттрансляционная модификация белков-ферментов. Ионы Ca2+ и фосфатидилинозитиды в качестве вторичных мессенджеров. Рецепция света живыми системами 52. Физико-химические характеристики воды как универсального растворителя в биологических системах. Основные понятия электрохимии водных растворов. Закон действующих масс, константы диссоциации кислот и оснований, водородный показатель (рН), буферные растворы. 53. Фотосинтез. Структура фотосинтетического аппарата. Хлорофилл и фотосинтетические антены. Структура фотосинтетических реакционных центров. Световые и темновые стадии фотосинтеза. Фотосистемы I и II. Реакция Хилла. Ферредоксины. Цикл Кальвина. 54. Хранение и реализация генетической информации. 55. Электрохимия осмотических явлений. Методы изучения биологических мембран (репортёрные метки, микрокалориметрия, светорассеивание). 16 56. Энергетическое сопряжение. Фосфорильный потенциал клетки. Нуклеозид ди- и три- фосфаткиназы. Аденилаткиназная и креатинкиназная реакции. 57. ЭПР и ЯМР – спектроскопия, калориметрия, микрокалориметрия, электрофорез, вискозиметрия, рентгеноструктурный анализ, хромато-масс спектрометрия, ГЖХ, ВЭЖХ. IY. СПИСОК РЕКОМЕНДУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ И ИСТОЧНИКОВ Основная литература 1. Rehm, H. Protein Biochemistry and Proteomics/ Н. Rehm, - Amsterdam Boston Heidelberg: Elsevier Academic Press, 2006. - 236p. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:591084&theme=FEFU 2. Нельсон, Д.Л. Основы биохимии Ленинджера: учебник 3т./ Д.Л. Нельсон, М. Кокс, пер. с англ. Т.П. Мосоловой, Е. М. Молочкиной, В. В. Белова. – М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2012. – 694с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:668172&theme=FEFU 3. Северина, С.Е. Биохимия: учебник для медицинских вузов / [Л. В. Авдеева, Т. Л. Алейникова, Л. Е. Андрианова и др.]; под ред. Е. С. Северина. – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2013. – 759с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:695358&theme=FEFU 4. Рогожин, В. В. Практикум по физиологии и биохимии растений: учебное пособие для вузов / В.В. Рогожин, Т.В. Рогожина. – СПб.: ГИОРД, 2013. – 348с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:736961&theme=FEFU 5. Афанасьев, Ю.И. Гистология, эмбриология, цитология: учебник для высшего профессионального образования / Ю.И. Афанасьев, Н.А. Юрина, Б.В. Алешин и др.; под ред. Ю.И. Афанасьева, Н.А. Юриной. – М.: ГОЭТАРМедиа, 2013. – 798с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:695450&theme=FEFU 17 6. Волькенштейн, М.В. Биофизика: учебное пособие / М.В. Волькенштейн. – СПб.: Лань, 2012. – 595с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:694448&theme=FEFU 7. Самойлов, В.О. Медицинская биофизика: учебник для вузов / В.О. Самойлов. – СПб.: Спец.Лит., 2013. – 591с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:736960&theme=FEFU 8. Pогожин, В.В. Биохимия животных: учебник для вузов / В.В. Рогожин. – СПб.: 2009. – 552с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:353962&theme=FEFU 9. Комов, В.П. Биохимия: учебник для вузов / В.П. Комов, В.Н. Шведова. – М.: Дрофа, 2008. – 688с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:353436&theme=FEFU Дополнительная литература 1. Василенко, Ю.К. Биологическая химия: учебное пособие для вузов / Ю.К. Василенко. – М.: Медпресс-информ, 2011. – 431с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:704185&theme=FEFU 2. Спирин, А.С. Молекулярная биология. Рибосомы и биосинтез белка: учебник для вузов по биологическим специальностям / А. С. Спирин. – М.: Академия, 2011. – 498с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:669007&theme=FEFU 3. Уэй, Т. Физические основы молекулярной биологии: учебное пособие / Т. Уэй; пер. с англ. под ред. Л. В. Яковенко. - Долгопрудный: Интеллект, 2011. – 363с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:663865&theme=FEFU 4. Ленинджер, А.Л. Основы биохимии. В 3-х т.: т. 1: пер. с англ. / А. Л. Ленинджер; под ред. В.А. Энгельгардта, Я.М. Варшавского. - М.: Мир, 1985. – 345с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:51713&theme=FEFU 5. Ленинджер, А.Л. Основы биохимии. В 3-х т.: т. 2: пер. с англ. / А. Л. Ленинджер; под ред. В. А. Энгельгардта, Я. М. Варшавского. – М.: Мир, 1985 – 420с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:51714&theme=FEFU 18 6. Ленинджер, А. Л. Основы биохимии. В 3-х т.: т. 3: пер. с англ. / А. Л. Ленинджер; под ред. В. А. Энгельгардта, Я. М. Варшавского. – М.: Мир,1985- 387с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:51715&theme=FEFU 7. Мусил, Я. Современная биохимия в схемах / Я. Мусил, О. Новакова, К. Кунц; пер. с англ. С. М. Аваевой, А. А. Байкова. – М.: Мир, 1981 – 215с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:44867&theme=FEFU 8. Сингер, М. Гены и геномы в 2 т.: т. 1 / М. Сингер, П. Берг; под ред. Н. К. Янковского; пер. с англ. Т. С. Ильиной, Ю. М. Романовой. – М.: Мир, 1998. – 373с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:23576&theme=FEFU 9. Сингер, М. Гены и геномы в 2 т.: т. 2 / М. Сингер, П. Берг; под ред. Н. К. Янковского; пер. с англ. Т. С. Ильиной, Ю. М. Романовой. – М.: Мир, 1998. – 286с. http://lib.dvfu.ru:8080/lib/item?id=chamo:286556&theme=FEFU 10. Ткаченко, К.В. Микробиология. [Электронный ресурс]: учебное пособие / К.В. Ткаченко. – Саратов: Изд-во Научная книга, 2012. – 159с. http://www.iprbookshop.ru/8208.html 11. Журавская, О.А. Основы биоорганической химии. [Электронный ресурс]: учебное пособие / О.А. Журавская. – Самара: Изд-во РЕАВИЗ, 2012. –52с. http://www.iprbookshop.ru/10151.html 12. Пинчук, Л.Г. Биохимия. [Электронный ресурс]: учебное пособие / Л.Г. Пинчук, Е.П. Зинкевич, С.Б. Гридина. – Кемерово: Изд-во: Кемеровский технологический институт пищевой промышленности, 2011. – 364с. http://www.iprbookshop.ru/14362.html 13. Плакунов, В.К. Основы динамической биохимии. Учебник. [Электронный ресурс]: учебное пособие/ В.К. Плакунов, Ю.А. Николаев. – М.: Логос, 2010. – 216с. http://www.iprbookshop.ru/9095.html 14. Осипова, О.В. Биоорганическая химия. Учебник. [Электронный ресурс]: учебное пособие / О.В. Осипова, А.В. Шустов. – Саратов: Изд-во Научная книга, 2012. –367с. http://www.iprbookshop.ru/8178.html 19