В разделах «Анализ особенностей в структуре и содержании образовательного процесса в университете исследовательского типа», «Разработка основных показателей научной деятельности исследовательского университета» и «Изучение особенностей и разработка механизмов включения институтов РАН, РАМН и других научных центров в учебный процесс исследовательского университета» рассматриваются основные тенденции процесса эволюции структуры и содержания российского классического университетского образования и выделяются особенности, отражающие основные задачи и цели университета исследовательского типа, анализируются основные показатели научной деятельности такого университета (актуальность, уровень продуктивность и масштаб исследований, значимость фундаментальных НИР, прикладных исследований, эффективность коммерциализации результатов НИОКР, использование результатов НИОКР в учебном процессе, активность научной работы студентов, молодых ученых). При выделении механизмов взаимодействия исследовательского университета и академических НИИ основное внимание уделяется созданию учебно-научных центров или центров фундаментальных исследований элитарного образования и учебно-научно-инновационных комплексов, так как исследовательский университет должен представлять собой системно управляемую совокупность учебно-научных центров и учебно-научно-инновационных комплексов, функционирующих на основе ведущих научных школ. Учебно-научные центры обеспечивают фундаментальные научные исследования в области точных, естественных и гуманитарных наук и опережающую подготовку кадров высшей квалификации, а в учебно-научно-инновационных комплексах технологическая деятельность и определяющей является инновационно- обеспечение кадрового сопровождения высокотехнологичных разработок. При этом раздел «Разработка основных показателей инновационной возможные деятельности механизмы исследовательского реализации инновационной университета» стратегии рассматривает исследовательского университета, в том числе и создание специальных подразделений для управления инновациями в масштабах вуза (например, Центра управления и развития инновационной деятельности исследовательского университета «Инновационно – методический центр») и анализирует основные показатели эффективности модели в этом отношении: создание на базе университета, подразделений институтов РАН и инновационных предприятий региона учебно-научно – инновационных комплексов, обеспечивающих эффективную коммерциализацию наукоемких разработок и технологий, подготовку квалифицированных кадров в области инновационного и технологического менеджмента; разработка нормативно – правовой базы, учитывающей различия в формах собственности субъектов инновационной деятельности; разработка и издание учебно-методических пособий, учебников (в т.ч. электронных) по инновационному и технологическому менеджменту; реализация силами учебно- научных центров и УНИК конкретных проектов коммерциализации и вывода на рынок разработок работников университета и институтов РАН; активное участие аспирантов, студентов, научной молодежи в разработке и реализации инновационных проектов, в организации инновационной деятельности. Важным признаком исследовательского университета можно считать наличие в структуре образования образовательных программ, соответствующих проблемам науки и разработке новейших наукоемких актуальным технологий, а также образовательных программ инновационного типа. Структура учебного процесса в исследовательском университете должна максимально обеспечивать академическую мобильность студентов. Таким образом, будет предоставлена возможность талантливым студентам из других вузов поступать для завершения своего образования в университет исследовательского типа. Одновременно студенты исследовательского университета могут использовать возможность обучения в ведущих зарубежных и отечественных вузах для получения специальных знаний. Наиболее этому соответствует многоуровневая система образования. Обязательное условие этой системы - присутствие в учебных планах элективных и факультативных дисциплин, что не только позволяет студенту выстраивать индивидуальную образовательную траекторию, но и легче отражать в учебных планах специфику ведущих научных школ. Важным показателем исследовательского университета нужно считать число магистерских и аспирантских программ, а также численность магистрантов и аспирантов. С одной стороны контингент их не может значительно превышать контингент студентов I и II уровней для того, чтобы обеспечить отбор наиболее талантливых. С другой стороны, учитывая, что исследовательский университет преимущественно должен быть настроен на подготовку научных кадров высокой квалификации, число магистрантов и аспирантов должно увеличиваться за счет талантливых студентов из других вузов. Важным элементом обучения в исследовательском университете нужно считать повышение уровня креативности студентов, что может осуществляться разными путями. Первое - это изменение соотношения аудиторной нагрузки и самостоятельной работы в сторону существенного увеличения последней и уменьшения первой. В российских университетах эта тенденция проявляется слабо в силу того, что не всегда имеется возможность обеспечить каждого студента в полной мере литературой, индивидуальным местом для самостоятельной работы и т.д. В ведущих зарубежных университетах доля самостоятельной работы значительно выше аудиторной. Одним из существенных моментов в организации учебного процесса в исследовательских университетах является индивидуализация обучения. Она выражается не только в возможности построения индивидуальных образовательных траекторий, но и в назначении научных руководителей для выполнения ряда предусмотренных учебным планом заданий.