1. ЦЕЛИ ОСВОЕНИЯ ДИСЦИПЛИНЫ: дать студентам теоретические, методологические и практические знания по биохимии человека и животных, формирующие основу для освоения профилирующих учебных дисциплин и выполнения основных профессиональных задач специалиста – микробиолога. В процессе освоения данной дисциплины студент формирует и демонстрирует следующие общепрофессиональные компетенции: знание принципов структурной и функциональной организации биологических объектов и механизмов гомеостатической регуляции; применяет основные физиологические методы анализа и оценки состояния живых систем (ПК-3) знание принципов клеточной организации биологических объектов, биофизических и биохимических основ, мембранных процессов и молекулярных механизмов жизнедеятельности (ПК-4) применяет современные экспериментальные методы работы с биологическими объектами в полевых и лабораторных условиях, навыки работы с современной аппаратурой ( ПК-5) Задачи дисциплины. приобретение студентами теоретических знаний по структурной и функциональной организации биологических объектов и механизмов гомеостатической регуляции привить студентам практические навыки в подготовке, организации и выполнении лабораторного практикума овладение студентами навыками грамотного и рационального оформления выполняемых экспериментальных работ развитие у студентов умения работы с учебной, справочной литературой и другими источниками информации 2. МЕСТО ДИСЦИПЛИНЫ В СТРУКТУРЕ ООН ВПО. Дисциплина «Биохимия человека и животных» относится к базовой части профессионального цикла дисциплин. Цикл Б.3. Дисциплина изучается в 4 семестре. Для освоения дисциплины студенты используют знания, умения и виды деятельности, сформированные в процессе изучения учебных курсов и дисциплин биологического и химического профилей в предыдущих семестрах, а также в ходе освоения дисциплины «Физиология», «Морфология», «Биохимия». Дисциплина «Биохимия человека и животных» является основной для изучения таких областей знаний как «Микробиология», «Генетика», «Биотехнология», «Иммунология». 3.КОМПЕТЕНЦИИ ОБУЧАЮЩЕГОСЯ, ФОРМИРУЮТСЯ В ПЕЗУЛЬТАТЕ ОСВОЕНИЯ ДИСЦИПЛИНЫ. 3.1. Общекультурные и профессиональные компетенции Изучение дисциплины «Биохимия человека и животных» направлено на формирование у студентов профессиональных компетенций: знание принципов структурной и функциональной организации биологических объектов и механизмов гомеостатической регуляции; применяет основные физиологические методы анализа и оценки состояния живых систем (ПК-3) знание принципов клеточной организации биологических объектов, биофизических и биохимических основ, мембранных процессов и молекулярных механизмов жизнедеятельности (ПК-4) применяет современные экспериментальные методы работы с биологическими объектами в полевых и лабораторных условиях, навыки работы с современной аппаратурой ( ПК-5) 3.2. В результате освоения дисциплины обучающийся должен: 1) знать: теоретические основы, достижения и проблемы современной биохимии, необходимые для осуществления в будущем профессиональной деятельности организацию, свойства, функции, основные пути метаболизма белков, липидов и углеводов в организме человека и животных современные основы биохимии клетки 2) уметь: писать химические реакции, связанные с обменом белков, углеводов, липидов подготовить и провести эксперимент по изучению свойств и идентификации важнейших соединений в биологическом материале использовать необходимые приборы и оборудование для проведения лабораторных исследований сравнить полученные данные и идентифицировать их с применяемыми методами 3) владеть: рядом современных лабораторных методов исследования белков, ферментов, углеводов, липидов методиками работ на лабораторном оборудовании теоретическими знаниями и практическими навыками для решения профессиональных задач в области биологии основами научного мировоззрения, диалектического и материалистического мышления 4. ОРГАНИЗАЦИОННО-МЕТОДИЧЕСКИЕ ДАННЫЕ Общая трудоемкость дисциплины составляет 4 зач.ед. и их распределение по видам работ представлено в таблице 1 Таблица 1 Вид учебной работы Трудоемкость час. Общая трудоемкость дисциплины по учебному плану Аудиторные занятия Лекции(А) Практические занятия (ПЗ) КСР Самостоятельная работа студентов (СРС) Вид контроля – экзамен 144 56 16 34 6 61 СТРУКТУРА И СОДЕРЖАНИЕ ДИСЦИПЛИНЫ. 4.1. Структура дисциплины «Биохимия человека и животных» Раздел 1. Обмен углеводов в организме человека и животных Раздел 2. Обмен липидов в организме человека и животных. Раздел 3. Обмен белка организме человека и животных Раздел 4. Взаимосвязь и регулирование обмена веществ в организме Раздел 5. Биохимия крови и ряда других биологических жидкостей 4.2. Трудоемкость разделов дисциплины Таблица 2 № п/п Раздел дисциплины Семестр Виды учебной работы Всего часов 1. 2. 3. 4. 5 Форма контроля Обмен углеводов в организме человека и животных Обмен липидов в организме человека и животных Обмен белка организме человека и животных. 4 29 Ауди торных 12 4 22 8 2 6 1 13 Колл-ум Тек. опрос 4 26 12 4 8 1 13 Колл-ум Дискуссия Тек. опрос Взаимосвязь и регулирование обмена веществ в организме. Биохимия крови и ряда других биологических жидкостей 4 25 12 4 8 1 12 Дискуссия Тек. опрос 4 15 6 2 4 2 7 Дискуссия 54 16 34 6 61 ИТОГО 27 144 Лек ции ЛПЗ КС Р Сам. раб 4 8 1 16 Колл-ум Тек. опрос Экзамен Матрица формирования компетенций по дисциплине «Биохимия человека и животных» Таблица 3 № п/п 1 2 3 4 5 Раздел дисциплины Раздел 1 Раздел 2 Раздел 3 Раздел 4 Раздел 5 Профессиональные компетенции ПК-3 ПК-4 ПК-5 Х Х Х Х Х Х Х Х Общее количество компетенций Х Х Х Х 2 3 3 2 2 Содержание дисциплины Раздел 1. Обмен углеводов в организме человека и животных Биологическое значение углеводов. Процессы диссимиляции углеводов в пищеварительном тракте моно- и полигастричных. Ферментативные превращения углеводов в ходе гликолиза. Гликогенолиз, брожение. Энергетический баланс гликолиза. Процессы диссимиляции углеводов в аэробных условиях. Аэробный путь окисления углеводов. Цикл трикарбоновых кислот. Энергетический баланс ЦТК и полного аэробного расщепления глюкозы. Пентозофосфатный путь окисления глюкозы и его биологическое значение. Глюконеогенез. Роль глюконеогенеза в метаболизме высокопродуктивных молочных коров. Раздел 2. Обмен липидов в организме человека и животных. Липиды. Биологическая роль липидов. Классификация липидов. Изменения жиров в процессе производства и хранения. Процессы диссимиляции липидов. Гидролиз жиров. Окисление жирных кислот и глицерина. Энергетическая эффективность распада жирных кислот. Кетоновые тела. Молекулярные механизмы возникновения кетозов у высокопродуктивных молочных коров. Липиды. Биосинтез жирных кислот. Синтез триацилглицеридов. Обмен и биологическая роль холестерина и фосфолипидов. Раздел 3. Обмен белка организме человека и животных Процессы диссимиляции белков и аминокислот. Процессы диссимиляции углеводов в пищеварительном тракте моно- и полигастричных. Гидролиз белков. Изменения в мясе при хранении. Гниение белков. Микробиальный синтез белков. Полноценные и неполноценные белки. Пути превращения аминокислот. Обезвреживание аммиака. Биосинтез белка и его основные этапы Раздел 4. Взаимосвязь и регулирование обмена веществ в организме Взаимосвязь процессов обмена веществ в организме. Связь процессов катаболизма и анаболизма, энергетических и конструктивных. Взаимосвязь между обменами белков, углеводов, нуклеиновых кислот, липидов Гормоны. Классификация гормонов. Рецепторы гормонов. Молекулярные механизмы передачи гормонального сигнала. Гормоны гипофиза и гипоталамуса. Гормоны периферических эндокринных желез. Гормоны щитовидной железы, паращитовидных желез, поджелудочной железы, надпочечников. Половые гормоны. Раздел 5. Биохимия крови и ряда других биологических жидкостей Химический состав крови. Белки, углеводы, липиды и другие органические вещества крови. Минеральный состав крови. Особенности химического состава и обмена веществ форменных элементов. Практическое использование белков крови. Возрастные и видовые особенности химического состава крови животных. Химический состав лимфы. 4.3. Самостоятельное изучение разделов дисциплины Самостоятельная работа по дисциплине включает: самоподготовку к учебным занятиям по конспектам, учебной литературе и с помощью электронных ресурсов (контролируются конспекты и др.); оформление и подготовка рефератов, докладов, эссе; подготовка к текущему тестированию по разделам дисциплины (изучение учебных тем). Таблица 5 Перечень вопросов для самостоятельного изучения № раздела 1. Обмен углеводов в организме человека и животных 2. Обмен липидов в организме человека и животных 3. Обмен белка организме человека и животных Перечень рассматриваемых вопросов Количество для самостоятельного изучения часов Переваривание, функции и строение 16 углеводов. Спиртовое брожение. Пентозофосфатный путь превращения углеводов. Функции и строение липидов. 13 Холестерин, его роль. Переваривание и гниение Полноценный белок. белка. 13 4. Взаимосвязь и регулирование обмена веществ в организме 5. Биохимия крови и ряда других биологических жидкостей Эндокринная регуляция организма. Классификация гормонов. 12 Минеральный состав крови. Практическое использование белков крови. 7 61 Итого: 5. ОБРАЗОВАТЕЛЬНЫЕ ТЕХНОЛОГИИ. Организация занятий по дисциплине «Биохимия человека и животных» проводится по видам учебной работы - лекции, лабораторно-практические занятия, самостоятельная работа, текущий и итоговый контроль. В соответствии с требованиями ФГОС ВПО по направлению подготовки бакалавра предусматривает реализация использование в компетентностного учебном процессе подхода активных и интерактивных форм проведения занятий в сочетании с внеаудиторной работой с целью формирования и развития профессиональных навыков обучающихся. Часть лекционных занятий проводится в поточной аудитории с применением мультимедийного проектора в виде учебной презентации. Основные моменты лекционных занятий конспектируются. Отдельные темы предлагаются для самостоятельного изучения с обязательным составлением конспекта (контролируется). Проводятся лабораторные работы, включающие: работы помогающие освоению научно-технических основ биологической химии и овладению техникой эксперимента, освоению основных методов работы в биохимической лаборатории. Изучение каждого раздела заканчивается проведением тестового контроля и коллоквиумом, а также семинарскими занятиями. Семинарские занятия проводятся в специальных аудиториях, оборудованных необходимыми наглядными материалами. В ходе проведения лабораторно- практических занятий используются интерактивные методы обучения: решение Организуется ситуативных задач, творческие задания. самостоятельная работа, студентов по освоению учебного материала в домашних условиях и в читальном зале библиотеки в ходе подготовки к коллоквиумам и лабораторным работам, а также в лаборатории под контролем преподавателя. Удельный вес занятий, проводимых в интерактивных формах, составляют не менее 30% аудиторных занятий, т.е. по данной дисциплине не менее 17 часов. Таблица 6 Программа проведения активных и интерактивных занятий по дисциплине учебного плана № Наименование темы п/п 1. 2. 3. 4. 5. Анализ продуктов жирового обмена Биосинтез белка Взаимосвязь обмена веществ в организме Гормоны. Механизм их действия Биохимия крови и ряда других биологических жидкостей Интерактивные лекции, час Виды активных и интерактивных семинарских занятий, час Семинар, Анализ конкретных дискуссия ситуаций 2 2 2 2 3 2 2 2 1. Проведение лабораторной работы при изучении липидов «Анализ продуктов жирового обмена» позволит лучше понять процесс распада жира в живом организме. 2. Дискуссия «Биосинтез белка» заключается в проведении учебной групповой дискуссии по конкретной проблеме, что требует подготовительной работы со стороны студентов, которые должны подобрать литературу, составить план и раскрыть содержание темы. К участию в дискуссии привлекаются все студенты. 3. Тема «Взаимосвязь обмена веществ в организме» носит явно выраженный теоретический характер и имеет ряд достаточно сложных для восприятия и усвоения студентами разделов. Проведение лекции в интерактивной форме позволяют в данном формате быстро и легко усваивать информацию, представленную визуально, а групповое обсуждение еѐ с помощью дискуссии позволяет лучше понять и закрепить полученные знания. 4. Изучение темы «Гормоны» в форме интерактивной лекции позволяют в данном формате быстро и легко усваивать информацию, представленную визуально (таблицы, схемы). В процессе лекций демонстрируются презентации, где последовательно излагаются основные вопросы, схематично изображены отдельные особенности. Отдельные моменты студентами могут конспектироваться. Презентационный материал находится у ведущего преподавателя. Опрос по теме «Гормоны» проходит в виде дискуссии и требует подготовительной работы студентов. Тема направлена на выявление межпредметных связей с дисциплинами «Физиология», «Анатомия». Опрос проходит в форме группового обсуждения, что требует вовлечения в коммуникацию всех участников группы. 5. Дискуссия по теме «Биохимия крови и ряда других биологических жидкостей» требует подготовительной работы студентов. Дискуссия проходит в форме группового обсуждения, что требует вовлечения в коммуникацию всех участников группы. Обсуждается состав и физикохимические свойства крови, патологические компоненты. В ходе проводимой лабораторной работы по изучению химического состава крови студенты приобретают навыки работы в химической лаборатории с химической посудой и реактивами. 6. ОЦЕНОЧНЫЕ СРЕДСТВА ДЛЯ ТЕКУЩЕГО КОНТРОЛЯ УСПЕВАЕМОСТИ, ПРОМЕЖУТОЧНОЙ АТТЕСТАЦИИ ПО ИТОГАМ ОСВОЕНИЯ ДИСЦИПЛИНЫ И УЧЕБНО-МЕТОДИЧЕСКОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ САМОСТОЯТЕЛЬНОЙ РАБОТЫ СТУДЕНТОВ. Вопросы к коллоквиуму обмен углеводов в организме человека и животных 1.Переваривание углеводов в желудочно-кишечном тракте моно- и полигастричных животных. 2.Синтез и распад гликогена (гликогенез и гликогенолиз ). 3.Гликолиз- главный путь утилизации глюкозы в клетках: а) последовательность реакций б) энергетический баланс и биологическое значение гликолиза в) регуляция гликолиза г) включение других углеводов в процесс гликолиза 4.Окислительное декарбоксилирование пирувата. Цикл Кребса. Общая характеристика. Последовательность реакций. Регуляция. Биологический смысл аэробного расщепления глюкозы. Расчет количества АТФ при полном окислении глюкозы. 5.Пентозофосфатный путь окисления углеводов. Биологическая роль. Взаимосвязь с гликолизом. 6.Глюконеогенез. Регуляция глюконеогенеза. Роль глюконеогенеза в метаболизме высокопродуктивных молочных коров. Вопросы к коллоквиуму обмен липидов в организме человека и животных 1. Классификация и биологические функции липидов в организме. 2. Переваривание жиров в желудочно-кишечном тракте. Роль желчных кислот в процессе переваривания жира. 3. Распад жиров в организме. Путь катаболизма глицерина в процессе липолиза. βокисление жирных кислот: активирование жирных кислот, перенос жирных кислот в матрикс митохондрий, реакции окисления жирных кислот в митохондриях. Выход энергии при полном окислении жирных кислот. 4. Синтез кетоновых тел. Роль кетоновых тел в периферических тканях. Молекулярные аспекты возникновения кетозов у высокопродуктивных коров. 5. Биосинтез жиров в тканях. а) биосинтез глицерина б) биосинтез жирных кислот. Незаменимые жирные кислоты. в) биосинтез триацилглицеридов. 6. Обмен фосфолипидов в организме. а) катаболизм фосфолипидов. б) синтез фосфолипидов. 7. Холестерин, его биологическая роль. Вопросы к коллоквиуму обмен белка в организме человека и животных 1.Переваривание белков. Особенности превращения азотсодержащих веществ у жвачных животных. Микробиальный синтез белка у жвачных. Значение белков микробиального синтеза в питании жвачных животных. Полноценные и неполноценные белки. Гниение белков в кишечнике под влиянием бактерий и механизм обезвреживания токсичных продуктов. 2.Биосинтез белков и его основные этапы (активирование аминокислот, инициация трансляции, элонгация трансляции, терминация трансляции, постсинтетическая модификация белков). Регуляция синтеза белков. 3.Общие пути превращения аминокислот в тканях (дезаминирование, переаминирование, декарбоксилирование). Кетогенные и гликогенные аминокислоты. 4.Обезвреживание аммиака в организме (образование глутамина, восстановительное аминирование пировиноградной и кетоглутаровой кислот, аспарагина, орнитиновый цикл мочевинобразования). Вопросы к дискуссии: «Биосинтез белка». 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. Активация аминокислот в процессе биосинтеза белка. Инициация трансляции. Элонгация трансляции. Терминация трансляции. Постсинтетическая модификация белков. Регуляция биосинтеза белка. Действие токсических и лекарственных веществ на биосинтез белка. Вопросы к дискуссии «Взаимосвязь обмена веществ в организме». 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. Общие принципы взаимосвязи метаболических путей. Ключевые метаболиты. Взаимосвязь обмена белков и нуклеиновых кислот. Взаимосвязь обмена нуклеиновых кислот и углеводов. Взаимосвязь обмена нуклеиновых кислот и липидов. Взаимосвязь обмена белков и углеводов. Взаимосвязь обмена белков и липидов. Взаимосвязь обмена углеводов и липидов. Вопросы к дискуссии «Биохимия крови и ряда других биологических жидкостей» 1. Химический состав крови. Белки, углеводы, липиды и другие органические вещества крови. 2. Минеральный состав крови. 3. Особенности химического состава и обмена веществ форменных элементов. 4. Практическое использование белков крови. 5. Возрастные и видовые особенности химического состава крови животных. 6. Химический состав лимфы. ПРИМЕРНЫЕ ВОПРОСЫ к экзамену по биохимии человека и животных 1. Химические элементы, молекулы, ионы, входящие в состав живых организмов. 2. Обмен веществ между организмом и окружающей средой как основное условие жизни. Ассимиляция (анаболизм) и диссимиляция (катаболизм). Пластический и функциональный обмен. 3. Основные классы биомолекул и их биологические функции 4. Биологическое значение углеводов. Переваривание углеводов в желудочнокишечном тракте моно и полигастричных животных. 5. Синтез и распад гликогена (гликогенез и гликогенолиз). 6. Анаэробный распад углеводов. Гликолиз. Общая характеристика. Последовательность реакций. Локализация в клетке. Биологическая роль. Энергетический баланс. 7. Расчет количества АТФ при полном окислении глюкозы. 8. Аэробный распад углеводов в организме. Окислительное декарбоксилирование пирувата. Цикл трикарбоновых кислот. Общая характеристика. Последовательность реакций. 9. Пентозофосфатный путь окисления углеводов общая характеристика и его значение. Взаимосвязь с гликолизом. 10. Глюконеогенез. Общая характеристика. Роль глюконеогенеза в метаболических процессах высокопродуктивных молочных коров. 11. Классификация липидов (простые и сложные). Фосфолипиды. Гликолипиды. Общая характеристика и биологическая роль. 12. Переваривание липидов в желудочно-кишечном тракте. Эмульгирование и значение этого процесса в обмене липидов. Жѐлчные кислоты и их биологическая роль. 13. Окисление жирных кислот в тканях. Последовательность реакций. Локализация в клетке. Баланс энергии. 14. Кетоновые тела. Образование, биологическое значение. Молекулярные механизмы возникновения кетозов у высокопродуктивных молочных коров. 15. Биосинтез насыщенных кислот. Последовательность реакций. Образование малонил-КоА. 16. Холестерин. Биологическая роль. Обмен. 17. Расщепление белков в процессе пищеварения. Особенности превращения азот содержащих веществ у жвачных животных. Микробиальный синтез белка в рубце жвачных. Значение белков микробного синтеза в питании жвачных. Полно ценные и неполноценные белки. 18. Гниение белков в кишечнике под влиянием бактерий и механизмы обезвреживания токсических продуктов. 19. Биосинтез белков и его основные этапы (активирование аминокислот: образование аминоацетиладенидатов и аминоацил-т РНК. Инициация трансляции, элонгация трансляции, терминация трансляции. Постсинтетическая модификация белка). 20. Обмен азота. Фиксация азота. 21. Пути превращения аминокислот в тканях: дезаминирование, трансаминирова-ние, декарбоксилирование. Кетогенные и гликогенные аминокислоты. 22. Обезвреживание аммиака в организме (синтез мочевины, глутамина, аспараги-на). 23. Распад нуклеиновых кислот в тканях. 24. Распад пуриновых оснований в организме животных. 25. Распад пиримидиновых оснований в организме. 26. Роль гормонов в обмене веществ. Номенклатура и классификация гормонов. 27. Основные пути действия гормонов на биохимические процессы. Использование гормонов в животноводстве в качестве стимуляторов продуктивности. 28. Механизм действия гормонов: мембранный, мембранно-внутриклеточный, цитозольный. 29. Гормоны щитовидной железы: тироксин, трииодтиронин. Структура, свойства, биологическое действие. 30. Парагормон, кальцитонин: структура, биологическая роль. 31. Гормоны мозгового вещества надпочечников (катехоламины) - адреналин и норадреналин. Строение, биологическая роль. 32. Гормоны коркового вещества надпочечников: глюкокортикоиды и минералокортикоиды. 33. Гормоны половых желез-андрогены и эстрогены. Структура, свойства, биологическая роль. 34. Гормоны передней доли гипофиза: кортикотролин, соматотропин, тиреотропин, фоллитропин, лютропин, пролактин. Строение. Биологическая роль, регуляция секреции. 35. Взаимосвязь процессов обменов веществ в организме. 36. Химический состав крови. Белки, углеводы, липиды и другие органические вещества крови. 37. Минеральный состав крови. 38. Особенности химического состава и обмена веществ форменных элементов. 39. Практическое использование белков крови. 40. Возрастные и видовые особенности химического состава крови животных. 41. Химический состав лимфы 7. УЧЕБНО-МЕТОДИЧЕСКОЕ И ИНФОРМАЦИОННОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ ДИСЦИПЛИНЫ (МОДУЛЯ). а) Основная литература. 1. Горбатова, Ксения Константиновна Биохимия молока и молочных продуктов / К. К. Горбатова, П. И. Гунькова. 4-е изд., перераб. и доп. - СПб. : ГИОРД, 2010. - 336 с. 2. Ковалевская Н.И. Биологическая химия / Под ред. Н.И. Ковалевской. - 2-е изд., перераб. и доп. - М. : Академия, 2008. - 256 с. 3. Рогожин В.В. Биохимия животных / В. В. Рогожин. - СПб. : ГИОРД, 2009. 552 с. 4. Стеценко И.И. Биологическая химия: программированное обучение. Учебно-методический комплекс / И.И. Стеценко, Е.Н. Любина. - Ульяновск : УГСХА, 2010. - 99 с. 5. Карасева, Елена Альбертовна. Клиническая интерпретация биохимических показателей сыворотки крови собак и кошек: научное издание / Е. А. Карасева, В. Н. Денисенко. - М. : КолосС, 2011. - 28 с 6. Т.В. Метревели «Биохимия животных» СПб, Лань, 2005, 246с б) Дополнительная литература 1. Кобалав Ж.Д. Ключевые моменты диагностики внутренних болезней. Учебное пособие.- Москва: Российский университет дружбы народов, 2011.398 с. 2. Меньщикова Е.Б., Зенков Н.К., Ланкин В.З., Бондарь И.А., Труфакин В.А. Окислительный стресс. Патологические состояния и заболевания. Учебное пособие.- Новосибирск: АРТА, 2008. 3. И.И. Стеценко, А.С. Сергатенко, Р.Н. Хансевярова «Практикум по биологической химии», Ульяновск, 2003, 92с 4. И.И. Стеценко, Р.Н. Хансевярова «Технологическая программа и логические задачи. Пособие по курсу биологической химии для студентов факультета ветеринарной медицины». Ульяновск, 2004, 63с. 5. Стеценко, Ирина Игоревна. Биологическая химия: учебно-методический комплекс / И.И. Стеценко, Е.Н. Любина - Ульяновск : УГСХА, 2008. - 208 с в) Интернет-ресурсы 1)Биохимия. Журнал Российской академии наук. Гл.ред. В.П. Скулачев .– [Электронный ресурс].–Режим доступа: http://elibrary.ru/title_about.asp 2) Структура белков: Swiss Prot [http:// au.expasy.ord/sport/]; Uniprot [http: // www expasy.uniprot.org]; Protein Data Bank [ http:// www. rcsb, org. / pdb/home/home.do];