Анализ протеома бактерии Staphylococcus aureus, штамм RF122. П.Бабкин, студент 1 курса Введение. [Русское название] Русское название бактерии Staphylococcus aureus – стафилококк золотистый. [Таксономия] Вид Staphylococcus aureus относят к роду Staphylococcus, семейству Staphyloccacaeae, порядку Bacillales, классу Bacillii, царству Bacteria [1] [Размер, фотография] Вид бактерии под микроскопом см. в файле Staphylococcus aureus.jpg (взят с сайта Http://wikipedia.com) . Длина бактерии примерно 0.5 мкм , толщина 1 мкм (http://www.mtonnel.ru) [Среда (среды) обитания и условия] Бактерия обитает на коже и слизистой носа человека. Типичные условия существования – Теже самые что и условия существования человека.(wikipedia.com). [Чем интересна человеку, почему ее геном секвенирован] Staphylococcus aureus очень интересна в связи ее способностью вызывать такие заболевания как язвы, гнойнички, фурункулы, карбункулы на коже, реже, (примерно в 25% случаев – воспаления в носу). Она может также обитать на домашних животных, таких, как собаки и кошки. Она вызывает опухоли цевок у кур. Геном бактерии Staphylococcus aureus секвенирован для того, чтобы способствовать разработке новых способов борьбы с ней. [(*) Интересные особенности бактерии] Также бактерия интересна своей феноменальной сопротивляемостью действию антибиотиков, таких как пенициллин, так в США только 2% бактерий данного вида чувствительны к пенициллину. Для отбора статей, посвященных среде обитания Staphylococcus aureus, написанных в 2006 году не на японском языке, был составлен запрос: Staphylococcus aureus habitat 2006 NOT jpn Статья о распространении Staphylococcus aureus в США: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=1467003 Геном и протеом Staphylococcus aureus [Статистические данные о геноме] Статистические данные о геноме приведены в табл.1 Они взяты с сайта http://www.ebi.ac.uk/genomes/bacteria.html Табл.1 Статистические данные о геноме Staphylococcus aureus Хромосома Число пар Число генов Суммарная или плазмида нуклеотидов длина генов (% от длины хромосомы или плазмиды) хр.1 кольцевая 2742531 2515 84% Суммарная длина межгенных промежутков (%) 84% GC состав (%) 32.8% [Длины белков] По данным с сайта http://www.ebi.ac.uk/genomes/bacteria.html число белков протеома Staphylococcus aureus совпадает с числом генов. (*)Так как один ген кодирует 1 белок протеома. Так как по моему штаму в базе данных не было информации о длине белков, я ипользовал информацию другого штамма Staphylococcus aureus(COL) Средняя длина-289, Максимальная-10498 Минимальная-21 Литература [1]http://www.en.wikipedia.org/wiki/Staphylococcus_aureus [2]http://www.mtonnel.ru/wiki/%D0%91%D0%B0%D0%BA%D1%82%D0%B5%D1%80%D0 %B8%D0%B8 (размеры Staphylococcus aureus)