Краткий отчёт ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России за 2013 год
реклама
Краткий отчет о научно-производственной деятельности ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России в 2013г. Структура и численность ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России Раздел «Наука» - 264 человек Научные сотрудники – 169, в том числе в возрасте до 39 лет - 53 Кандидатов наук – 74 человек, в том числе в возрасте до 39 лет - 15 Докторов наук – 27 человек, в том числе в возрасте до 39 лет - 0 Академиков РАМН – 3 Член-корр. РАМН -3 Раздел «Поликлиника» - 78 человек Недвижимость ФГУ НИИФХМ ФМБА России Вид деятельности – бюджетная Основные средства (наличие на конец 2013г.) – 288 362945,21 - Жилые помещения - Нежилые помещения - 19 176 322,00 - Сооружения 3533,00 - Машины и оборудование - 262 368 751,54 - Транспортные средства - 2 542 592,00 - Производственный и хозяйственный инвентарь - 4 271 746,67 - Библиотечный фонд Вид деятельности – приносящая доход деятельность Основные средства (наличие на конец 2013г.) – 80 463 870,48 - Жилые помещения - Нежилые помещения - Сооружения - Машины и оборудование - 75 851552,99 - Транспортные средства - Производственный и хозяйственный инвентарь - 4 612 318,49 - Библиотечный фонд - Финансово-экономическое положение учреждения В отчетном периоде (2013г.) для выполнения государственного задания было выделено в виде субсидий на общую сумму 53 765 100 руб., в том числе: - раздел/подраздел 0908 0819900 611 –40 112 000 руб.; - раздел/подраздел 0908, 4719900 611 – 13 653 100 руб. По состоянию на 01.01.2014г. перечислено утвержденных субсидий в полном объеме. В рамках соглашения о порядке и условиях предоставления субсидий из федерального бюджета на цели, не связанные с возмещением нормативных затрат на оказание государственных услуг, целевых субсидий на 2013 год перешел неиспользованный остаток 2012 года в размере 17 343 477,70 рублей. Получено субсидий в 2013 году 9 186 574,80 рублей. Доходы, полученные от приносящей доход деятельности, - 188 356 674 руб. Основные итоги научно-исследовательских работ Научно-исследовательскаядеятельность В соответствии с планом и техническим заданием на разработку научно-технической продукции, утвержденными ФМБА России, в 2013 году в НИИФХМ выполнялись три темы: «Разработка и внедрение методов постгеномной биологии в клиническую практику» (Шифр «Маркер»), «Разработка технологической платформы для создания диагностических устройств нового поколения с использованием микрофлюидных технологий» (Шифр «Микрофлюидика»), «Исследование молекулярных механизмов патогенеза социально-значимых заболеваний» (Шифр «Патогенез»). Основные итоги: В ходе протеомного исследования был разработан метод выделения из сыворотки крови наборов пептидов, репрезентативных для колоректального рака. Такой подход основан на фракционировании сыворотки крови с помощью магнитных микрочастиц с функционализированной поверхностью и последующей регистрацией выделенных пептидов МАЛДИ масс-спектрометрией. Использованные методы разделения крови позволили достоверно выявить пациентов с раком толстого кишечника и пациентов контрольных групп. Охарактеризован набор наиболее информативных и воспроизводимых протеомных маркеров, ассоциированных с патологией. Для оценки вклада генетических факторов в патогенез колоректального рака были проанализированы образцы ДНК, выделенные из биоптатов толстого кишечника. В ходе секвенирования генов TP53, APC, KRAS, BRAF и CTNNB1 был охарактеризован спектр генетических изменений, ассоциированных с колоректальным раком. Существенно дополнена база данных по патогенным мутациям в исследованных генах. В частности, выявлено 8 новых вариантов мутаций в гене TP53, 20 - в гене APC, 6 – в гене KRAS и ранее не охарактеризованная протяженная делеция гена CTNNB1. Общая выявляемость патологических изменений составила 57,8 %, что свидетельствует о высокой информативности анализа таких генетических вариантов для оценки риска развития новообразований. Впервые проведена оценка профиля метилирования промоторных областей ДНК трех кандидатных генов колоректального рака: SMARCA3, SEPT9 и CDH1. В ходе секвенирования бисульфит-конвертированной ДНК были показаны достоверные различия в уровне метилирования промоторов генов SMARCA3 и SEPT9 в образцах опухолевой ткани и образцах неизмененного эпителия тех же пациентов. Сравнительный анализ оптически прозрачных поверхностей для микрофлюидных систем методом атомно-силовой микроскопии показал преимущества ПДМС и слюды с локальными шероховатостями не более 10 нм. Неоднородности поверхности полистирола превышают аналогичные характеристики ПДМС и слюды. Химическая модификация оптически прозрачных поверхностей посредством аминирования и изотиоцианирования в органических растворителях приводит к нарушениям их прозрачности, поэтому оптимальным является аминирование в водных растворах полиаллиламинов. Для диагностики разработаны способы получения: 1) коллоидного золота с сорбцией очищенных антигенов; 2) наночастиц коллоидного серебра или золота, покрытых оболочкой диоксида кремния и вследствие этого стабильных при хранении и химических модификациях, необходимых для иммобилизации антигенов и антител, и поэтому более перспективных для дальнейших разработок микрофлюидных диагностических систем. Для конструирования микрофлюидной системы были выбраны оптически прозрачные материалы с наименьшей шероховатостью, получены наночастицы коллоидов серебра и золота, покрытых оболочкой из диоксида кремния, на поверхности которых иммобилизованы белковые антигены, и предложены два способа детекции оптических сигналов коллоидного серебра, для регистрации которых разработано программное обеспечение. Таким образом, поставленные задачи первого этапа полностью решены. Сформирована база данных, содержащая информацию о результатах метагеномного анализа образцов микробных сообществ, выявлены ассоциации между компонентами микробного состава и рядом заболеваний человека (иммунодефицит у детей, связанный с химиотерапией; нарушение баланса микробиоты у сотрудников вредного производства). Показано, что рисперидон и зонд К-35, как и фенилбутазон, связываются с альбумином в первом лекарственном центре, который служит основным местом связывания лекарств. Обнаружено, что первый лекарственный центр альбумина может находиться в разных структурных состояниях, то есть имеется структурная гетерогенность альбумина. Разные структурные формы этого связывающего центра различаются во много раз способностью связывать лекарства, а жирные кислоты существенно влияют на этот показатель. Проведено исследование эффективности топического применения и влияния на показатели противовирусного иммунитета иммунотропного пептида аллоферона у 45 пациенток, страдающих папилломавирусной инфекцией. Применение аллоферона у пациенток с хронической папилломавирусной инфекцией способствовало полному подавлению репликацию ВПЧ у 11 из 45 (24,4%) обследованных женщин, в 22 случаях (48,8%) отмечалась тенденция куменьшение концентрации ДНК ВПЧ (в среднем на 30,1%) и в 12 случаях (26,6%) концентрации ДНК ВПЧ не изменилась или даже увеличилась. Наибольшее количество случаев - 6 из 15 (40%), элиминации в цервикальном мазке ДНК ВПЧ наблюдалось в группе женщин, получавших Аллоферон в дозе 0,5 мг. При изучении влияния иммуноглобулинов на рост фибросаркомы у мышей было установлено, что скорость роста опухоли у контрольных (без инъекций IVIG) мышей линий СВА и С57/b достоверно не отличается. В то же время на фоне применения IVIG наблюдалось замедление роста опухоли по сравнению с контрольной группой у мышей СВА и ускорение – у мышей С57b. Доля нейтрофилов в крови мышей СВА под действием IVIG становилась достоверно выше, чем у интактных мышей и у мышей СВА без введения IVIG. Сопоставление данных о размерах опухоли и о содержании нейтрофилов указывает на связь между этими показателями Было изучено влияние гормона тимуса тимулина и иммунотропных препаратов из селезенки и кожи, не изученных ранее, на память, обучение и болевую чувствительность в норме и при стрессе. Был проведен химический синтез набора аналогов тромбиновогоаптамера TBA с триазольной модификацией межнуклеотидных связей, их очистка методом ВЭЖХ и подтверждение чистоты/структуры методом MALDI-TOF MS-спектрометрии. Физико-химическими методами (УФ-спетроскопия, спектроскопия кругового дихроизма) исследована структура полученных соединений. Определены стабильность новых аптамеров по отношению к нуклеазам (кинетика нуклеазного расщепления с детекцией методом EMSA) и их антикоагуляционная активность (IC50) в тесте на тромбиновое время. Несколько аптамеров продемонстрировали достаточно высокуюбиостабильность при сохранении ингибиторной активности. Анализ результатов выявил лидерное соединение, которое может быть использовано в антикоагуляционных препаратах в качестве основного действующего вещества. Кроме этого в 2013 году выполняются научно-исследовательские работы по следующим программам: ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы» Разработка и выпуск опытных образцов тест-системы для обнаружения лекарственно-устойчивого туберкулеза с учетом особенностей геномной организации эндемичных для России штаммов ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» - Создание мультифункциональной репортерной системы для оценки биоактивности различных химических веществ и биологических факторов неизвестного происхождения Гранты РФФИ - Разработка фундаментальных подходов к идентификации и коррекции атерогенных форм липопротеинов низкой плотности, возникающих под действием провоспалительного фермента – миелопероксидазы. - Разработка методики оценки содержания наночастиц золота в крови и исследование влияния наночастиц на клетки крови, а также систему свертования. - Расшифровка механизмов регуляции функции клеток природными реактивными оксидантами, относящимися к необратимым ингибиторам молекулярных мишеней. - Нековалентная функционализация однослойных углеродных нанотрубок как способ регуляции их взаимодействия с тромбоцитами и нейтрофилами. - Механизмы регуляции миелопероксидазой функциональных ответов клеток крови при воспалении. - Анализ биологического потенциала важнейших белков во вторичном метаболизме бактериальных симбиотов человека с использованием данных метагеномноного секвенирования. - Поиск новых систем регуляции экспрессии генов бактерий на модели Mycoplasmagallisepticum - Расшифровка механизмов формирования детерминант патогенности стрептококками группы viridans на основании сравнения полноразмерных нуклеотидных последовательностей их геномов ФЦП «Развитие фармацевтической и медицинской промышленности Российской Федерации на период до 2020 года и дальнейшую перспективу» -Разработка технологии и организации производства иммунодиагностических тест-систем на основе микрофлюидных технологий и наноструктурированных материалов. Отраслевые программы ФМБА России - Оценка уровня интенсивности каскадов биохимических реакций метаболизма лекарственных препаратов на основе метаболомных и протеомных показателей высококвалифицированных спортсменов в различных фазах тренировочного процесса (шифр АТЛЕТИКА 13); - Изучение индивидуальных особенностей генетического статуса высококвалифицированных спортсменов различных видов спорта и разработка индивидуальных алгоритмов подготовки на основе вариабельности генов, ассоциированных с метаболомом экзогенных циклических липидов (шифр ЛИПИДЫ 13). КОНТРАКТ № 004-2/13/2013-9 на выполнение составной части научноисследовательской работы «Поиск, синтез и тестирование новых антигипоксических соединений пептидной природы» шифр «Поиск-2-ФХМ» между ФГУ «НИИ ГПЭЧ» ФМБА России и ФГУ НИИ ФХМ ФМБА России. По итогам научно-исследовательской работы опубликовано 60 научных статей (в том числе 25 в зарубежных изданиях), сделано 45 научных докладов на отечественных и зарубежных конференциях, симпозиумах, съездах, получено 2 патента, подано 6 заявок на патент, защищены 1 докторская и 2 кандидатские диссертации Внебюджетная деятельность В 2013г. внебюджетная деятельность ФГУ «НИИ физикохимической медицины» ФМБА России осуществлялась по следующим программам и договорам: ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы»; ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России»; ФЦП «Развитие фармацевтической и медицинской промышленности Российской Федерации на период до 2020 года и дальнейшую перспективу» Программы ФМБА России по спорту; Гранты РФФИ; Платные услуги поликлинического отделения института. Внедрение результатов Внедрение результатов проведенных научных исследований осуществляется путем участия в международных и отечественных конференциях, выставках, проведения научных семинаров для врачейлаборантов, обучения специалистов по программам последипломного образования, чтения лекций и проведения практических занятий для студентов МФТИ, ММА им. И.М. Сеченова, МБФ РГМУ, МГМСУ, а также внедрения новых разработок в лаборатории научно-исследовательских институтов и клинических учреждений. В отчетном периоде 2013г. сотрудники института принимали участие в ежегодной сессии американской коллегии кардиологов (Сан-Франциско, США), в международном симпозиуме «Здоровое сердце» (Кельн, Германия), в совещании международного клинического испытания по оценке клинических эффектов препарата Эвацетрабил (Берлин, Германия), в ХХIYконгрессе международного общества по тромбозу и гемостазу (Амстерам, Недерланды), 9 ежегодной конференции метаболомного сообщества (Глазго, Великобритания), в международной научной конференции Европейского общества генетиков (Париж, Франция) – 2 чел., в конгрессе Европейского общества по атеросклерозу (Лион, Франция), в 23-м Европейском конгрессе по клинической микробиологии и инфекционным болезням (Берлин, Германия), в научной конференции международного общества по изучению экстрацеллюлярныхмикровезикул (Бостон, США).в конгрессе Европейского кардиологического общества (Амстердам, Нидерланды) – 2 чел., в конференции InternationalHumanMicrobiomeCongress(Ханчжоу, Китай), в конференции TheEMBOMeeting 2013 (Амстердам, Нидерланды), в работе школы по методам изоляции и характеристики экстраклеточныхмикровезикул (Будапешт, Венгрия), в конференции международного сообщества против туберкулеза (Париж, Франция), в 5-м конгрессе по сиквенсу (Лондон, Великобритания). Подготовка научных кадров I. Диссертанты и дипломники.Под руководством сотрудников института выполнены2 кандидатские диссертации и 12 дипломных проектов студентами РГМУ, МФТИ, ММА им. И.М.Сеченова, МГМСУ. II. Повышение квалификации – по программам последипломного профессионального образования подготовлено 30 слушателей из разных регионов России Состояние гражданской обороны Объекты недвижимости, которые находятся в оперативном управлении института, в основном построены в начале прошлого столетия и в связи с длительными сроками эксплуатации, а также по конструктивным особенностям несущих конструкций, не могут быть оборудованы защитными сооружениями, объекты не имеют автономных источников энергопотребления. Разработан и согласован с Главным управлением МЧС России по г. Москве план основных мероприятий ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России в области гражданской обороны, предупреждения и ликвидации чрезвычайных ситуаций, обеспечения пожарной безопасности и безопасности людей на водных объектах на 2014 год. Работники нештатных аварийно-спасательных формирований (НАСФ) ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России прошли обучение в учебно-методическом центре ГО и ЧС ЦФО Москвы (Б. Факельный пер. д2/32) в период с 17 по 21 января 2013 года. Директор института и его заместители прошли обучение в УНЦ ГО и ЧС ЦАО г. Москвы. Институт принял участие в проведении Всероссийской тренировки по гражданской обороне в октябре 2013г. Направления укрепления, совершенствования и развития В целях укрепления, совершенствования и развития научно исследовательской работы в институте созданы и функционируют лаборатория и инновационный центр медицинских нанотехнологий и сиквенс-центр. Эти центры оснащены современным высокопроизводительным оборудованием, что позволяет осуществлять разработку и внедрение новых высокопроизводительных методов чтения биологических текстов для медицины (расшифровка структуры ДНК, РНК, белков), а также проводить геномно-транскриптомный анализ эукариотических организмов и осущестлятьметагеномные проекты, включающие в себя изучение популяционного состава как природных географически изолированных микробиоценозов, так и особенностей симбионтно-паразитарной колонизации различных отделов организма человека.
